More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1622 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  49.18 
 
 
821 aa  772    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
974 aa  2020    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1291  putative surface layer protein, with cytochrome c domain  25.86 
 
 
620 aa  186  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.304881  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1705  hypothetical protein  27.78 
 
 
634 aa  160  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.41 
 
 
652 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  24.61 
 
 
827 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.33 
 
 
354 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.53 
 
 
353 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  26.32 
 
 
1094 aa  107  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  25.95 
 
 
387 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  27.38 
 
 
391 aa  101  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  29.5 
 
 
1667 aa  102  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.22 
 
 
689 aa  101  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.8 
 
 
354 aa  99.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  33.14 
 
 
335 aa  96.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  30.48 
 
 
580 aa  95.9  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.43 
 
 
354 aa  95.9  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  24.93 
 
 
810 aa  95.1  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.25 
 
 
327 aa  93.6  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  32.18 
 
 
819 aa  92.8  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.22 
 
 
320 aa  92.4  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.37 
 
 
312 aa  92.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.19 
 
 
366 aa  90.9  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32 
 
 
752 aa  90.9  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.25 
 
 
328 aa  89  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.96 
 
 
328 aa  88.6  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.79 
 
 
366 aa  88.6  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.5 
 
 
347 aa  88.2  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  31.08 
 
 
1189 aa  88.2  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.92 
 
 
317 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.96 
 
 
328 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1984  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.12 
 
 
464 aa  87  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.584863  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.33 
 
 
313 aa  86.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.47 
 
 
1170 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  36.69 
 
 
971 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.36 
 
 
478 aa  86.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581027  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.5 
 
 
348 aa  86.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2667  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.36 
 
 
478 aa  86.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896868  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  28.57 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  37.9 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.12 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  23.68 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.5 
 
 
348 aa  84.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  29.21 
 
 
479 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 
776 aa  84  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.59 
 
 
338 aa  83.2  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.56 
 
 
328 aa  83.2  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.92 
 
 
451 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.3 
 
 
314 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.59 
 
 
415 aa  80.5  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.71 
 
 
318 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  32.54 
 
 
590 aa  79.7  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.45 
 
 
383 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  26.28 
 
 
556 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4934  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.5 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.224199 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3857  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.5 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.337785  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.77 
 
 
272 aa  79.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.06 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  29.89 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.04 
 
 
310 aa  79  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.83 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.7 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.3 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.51 
 
 
314 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.38 
 
 
330 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.21 
 
 
311 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.46 
 
 
311 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.54 
 
 
517 aa  76.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.16 
 
 
316 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.29 
 
 
192 aa  76.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5386  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25 
 
 
479 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.786395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.19 
 
 
328 aa  75.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.19 
 
 
334 aa  76.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.22 
 
 
320 aa  76.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.71 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.2 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.31 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.24 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3795  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.08 
 
 
493 aa  75.1  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5257  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.85 
 
 
478 aa  74.7  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.91955  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.36 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23 
 
 
305 aa  73.9  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2620  hypothetical protein  28.06 
 
 
339 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0272263  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1839  hypothetical protein  30.77 
 
 
330 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.172437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0482  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.03 
 
 
326 aa  73.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.67 
 
 
943 aa  73.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  24.26 
 
 
339 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.65 
 
 
607 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  23.15 
 
 
1577 aa  73.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  32.41 
 
 
329 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5591  hypothetical protein  39.13 
 
 
171 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465628  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2064  hypothetical protein  30.34 
 
 
329 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1117  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.41 
 
 
329 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.949748 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6194  hypothetical protein  26.79 
 
 
348 aa  73.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.37 
 
 
329 aa  73.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5572  hypothetical protein  24.13 
 
 
965 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2172  hypothetical protein  32.41 
 
 
329 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2154  hypothetical protein  32.41 
 
 
329 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305615  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.38 
 
 
323 aa  73.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.06 
 
 
332 aa  72.8  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>