256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2247 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2247  putative methylamine utilization protein MauG precursor  100 
 
 
419 aa  863    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2005  putative cytochrome c peroxidase  30.93 
 
 
451 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0114  di-haem cytochrome c peroxidase  31.78 
 
 
483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3354  di-haem cytochrome c peroxidase  30.2 
 
 
449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  0.135039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2749  putative cytochrome c peroxidase  32.62 
 
 
437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0452779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3672  di-haem cytochrome c peroxidase  33.14 
 
 
498 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  30.06 
 
 
435 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0540  di-haem cytochrome c peroxidase  29.43 
 
 
499 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  28.34 
 
 
431 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  28.85 
 
 
768 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  27.83 
 
 
336 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  28.35 
 
 
384 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  29.87 
 
 
365 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  27.46 
 
 
616 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  30.46 
 
 
330 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  26.92 
 
 
521 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  26.14 
 
 
416 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  29.52 
 
 
343 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  25.48 
 
 
373 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  27.69 
 
 
334 aa  93.6  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  24.88 
 
 
427 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  29.7 
 
 
335 aa  90.5  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  25.56 
 
 
379 aa  89.7  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  28.39 
 
 
357 aa  89.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  26.65 
 
 
369 aa  89.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  25.37 
 
 
409 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  26.35 
 
 
424 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  25.84 
 
 
607 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  25.5 
 
 
359 aa  87  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  27.16 
 
 
311 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  27.3 
 
 
353 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  24.36 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  28.52 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  28.25 
 
 
337 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  26.49 
 
 
437 aa  84  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04385  Di-heme cytochrome c peroxidase  35.97 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  26.56 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  25.22 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  26.55 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  25 
 
 
626 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  25.71 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  25.71 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  25.71 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  27.8 
 
 
463 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  25 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  28.25 
 
 
348 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  27.48 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  27.48 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  27.8 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  27.8 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  27.8 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  28.75 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  28.75 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  27.8 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  28.75 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  28.75 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  25.47 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  25.62 
 
 
626 aa  80.1  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  25.41 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  25.66 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  25.28 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  26.65 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  24.87 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  26.52 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  28.75 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  27.61 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  26.32 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  23.93 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  26.64 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  26.14 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 
571 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  24.84 
 
 
304 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  24.05 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  25.99 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  25.34 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  24.51 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  25.41 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  25.71 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  26.67 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  24.24 
 
 
346 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  26.58 
 
 
417 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  27.76 
 
 
594 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  24.68 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  27.74 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  24.86 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  24.92 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  26.06 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  23.12 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  24.83 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  24.92 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  25.32 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  25.32 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  25.64 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  23.9 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 
598 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  25.88 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  24.72 
 
 
454 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  25.24 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  25 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  25.88 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>