197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04385 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04385  Di-heme cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 447 aa  929    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  27.81 
 
 		 768 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  27.39 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  26.89 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  28.42 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0114  di-haem cytochrome c peroxidase  29.13 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  28.69 
 
 		 340 aa  113  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  29.26 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  26.79 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  27.75 
 
 		 352 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  29.19 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 302 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  28.01 
 
 		 352 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  27.93 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  27.5 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  28.85 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  25.93 
 
 		 328 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  27.35 
 
 		 337 aa  107  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  26.65 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  26.18 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  28.42 
 
 		 352 aa  101  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  25.65 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  27.32 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  27.2 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  27.2 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  25.33 
 
 		 626 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  28.03 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  27.42 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  27.15 
 
 		 358 aa  97.8  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  26.46 
 
 		 353 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  27.48 
 
 		 350 aa  97.8  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  26.7 
 
 		 347 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  27.15 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  24.6 
 
 		 521 aa  96.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  27.03 
 
 		 346 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  26.74 
 
 		 598 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  26.14 
 
 		 594 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  28.24 
 
 		 616 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  24.18 
 
 		 330 aa  95.5  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  24.37 
 
 		 464 aa  95.5  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  28.53 
 
 		 357 aa  94.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  25.49 
 
 		 322 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  25.72 
 
 		 365 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  26.57 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  26.55 
 
 		 330 aa  93.6  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  26.44 
 
 		 352 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 330 aa  93.2  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  24.36 
 
 		 379 aa  93.2  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  25.27 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  26.4 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  27.33 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  25.41 
 
 		 473 aa  91.3  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3672  di-haem cytochrome c peroxidase  32.58 
 
 		 498 aa  90.1  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  25.61 
 
 		 417 aa  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  27.2 
 
 		 343 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  25.14 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  25.93 
 
 		 342 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  26.39 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  25.85 
 
 		 465 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  25.57 
 
 		 465 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  25.57 
 
 		 465 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  25.57 
 
 		 465 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  25.63 
 
 		 607 aa  87  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2247  putative methylamine utilization protein MauG precursor  25.53 
 
 		 419 aa  86.7  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  25.57 
 
 		 465 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  25.66 
 
 		 333 aa  86.7  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3354  di-haem cytochrome c peroxidase  29.7 
 
 		 449 aa  86.3  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  0.135039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  25.66 
 
 		 333 aa  86.7  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  24.84 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  27.03 
 
 		 345 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  28.02 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  24.93 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  24.18 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  26.3 
 
 		 626 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  25.57 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  26.05 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  26.8 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  25.57 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  26.76 
 
 		 594 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  25.61 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  25.66 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  23.57 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  24.5 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  24.5 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  25.07 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  25.96 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  25.07 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  25.75 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  25.79 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  26.97 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  25.26 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  24.66 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  24.72 
 
 		 339 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  26.33 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  26.32 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  24.43 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2749  putative cytochrome c peroxidase  35.67 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0452779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  27.22 
 
 		 571 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  25.27 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>