139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0679 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  75.15 
 
 		 509 aa  780    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 515 aa  1061    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  70.61 
 
 		 513 aa  759    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  75.79 
 
 		 522 aa  749    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  69.23 
 
 		 513 aa  745    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  60.71 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  58.74 
 
 		 466 aa  488  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  55.9 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  56.84 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  54.01 
 
 		 467 aa  465  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  54.98 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  54.12 
 
 		 466 aa  455  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  53.54 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  55.56 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  53.19 
 
 		 451 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  25.56 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  38.14 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  38.14 
 
 		 427 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  35.4 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  35.77 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  24.81 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  31.79 
 
 		 357 aa  67  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  32.38 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  31.62 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  28.89 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  29.7 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  32.23 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  33.85 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  29.12 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  32.9 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.03 
 
 		 821 aa  63.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.67 
 
 		 652 aa  63.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  27.57 
 
 		 334 aa  63.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  28.49 
 
 		 352 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  29.73 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  28.1 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  30.4 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  26.01 
 
 		 827 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  32.12 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  26.36 
 
 		 616 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  30.61 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  32.17 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  30.22 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  26.46 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  27.91 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  28.57 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  30.07 
 
 		 571 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  29.57 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  30.89 
 
 		 343 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  29.57 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  28.21 
 
 		 346 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  30.41 
 
 		 607 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  26.98 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  32.76 
 
 		 333 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  32.76 
 
 		 333 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  33.93 
 
 		 344 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  36.56 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  33.93 
 
 		 344 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  33.93 
 
 		 344 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  28.18 
 
 		 335 aa  54.7  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  28.38 
 
 		 598 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  29.34 
 
 		 346 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  31.9 
 
 		 333 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  33.93 
 
 		 344 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  33.04 
 
 		 333 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  30.41 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 369 aa  53.5  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  31.4 
 
 		 330 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  31.4 
 
 		 330 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  30.43 
 
 		 344 aa  53.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  33.04 
 
 		 333 aa  52.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  26.98 
 
 		 337 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  25.16 
 
 		 353 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  28.87 
 
 		 379 aa  52  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  23.53 
 
 		 398 aa  52  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  27.74 
 
 		 768 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  31.03 
 
 		 330 aa  51.6  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  26.97 
 
 		 390 aa  50.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  28.69 
 
 		 594 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  26.87 
 
 		 365 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  27.08 
 
 		 365 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  32.48 
 
 		 352 aa  51.2  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  29.5 
 
 		 594 aa  50.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  28.1 
 
 		 427 aa  50.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  25.31 
 
 		 416 aa  50.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  24.5 
 
 		 613 aa  50.4  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  26.88 
 
 		 351 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  26 
 
 		 626 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  28.18 
 
 		 342 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  30 
 
 		 359 aa  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3026  hypothetical protein  42.86 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.443921  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  29.75 
 
 		 339 aa  49.7  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1705  hypothetical protein  25.55 
 
 		 634 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  30.7 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0518  hypothetical protein  31.34 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  30.58 
 
 		 342 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  31.3 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  28.93 
 
 		 353 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  26.55 
 
 		 1577 aa  48.5  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>