95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0694 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  100 
 
 
466 aa  962    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  68 
 
 
467 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  58.71 
 
 
470 aa  551  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  59.12 
 
 
469 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  58.72 
 
 
467 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  58.04 
 
 
465 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  56.18 
 
 
466 aa  518  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  56.48 
 
 
467 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  58.49 
 
 
464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  58.59 
 
 
451 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  57.44 
 
 
513 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  58.74 
 
 
515 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  57.34 
 
 
513 aa  484  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  58.51 
 
 
522 aa  479  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  57.81 
 
 
509 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 
352 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  34.33 
 
 
365 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1755  Cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138624  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  33.77 
 
 
390 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  33.08 
 
 
339 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  24.13 
 
 
427 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  34.38 
 
 
427 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  30.53 
 
 
365 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  31.86 
 
 
336 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  31.34 
 
 
353 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  28.57 
 
 
361 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  31.58 
 
 
342 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  32.03 
 
 
465 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  33.59 
 
 
427 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  33.68 
 
 
333 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  30.53 
 
 
425 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  30.08 
 
 
333 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  33.58 
 
 
447 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  28.8 
 
 
352 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  28.8 
 
 
352 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 
346 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  28.17 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
357 aa  54.3  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  30.47 
 
 
358 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  36.27 
 
 
417 aa  53.9  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  29.32 
 
 
352 aa  53.5  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  29.32 
 
 
371 aa  53.5  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  29.05 
 
 
335 aa  53.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  28.21 
 
 
341 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  28.21 
 
 
341 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  32.09 
 
 
458 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  29.09 
 
 
379 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  23.73 
 
 
329 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 
369 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  27.98 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 
331 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  26.56 
 
 
594 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  29.53 
 
 
306 aa  51.2  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  30.58 
 
 
344 aa  50.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  27.18 
 
 
353 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  28.81 
 
 
626 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  28.81 
 
 
598 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4384  cytochrome-c peroxidase  25.93 
 
 
332 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  29.46 
 
 
302 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  29.61 
 
 
463 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  32.26 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  25.43 
 
 
594 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 
342 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  26.5 
 
 
344 aa  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  26.87 
 
 
352 aa  48.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  27.07 
 
 
355 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  29.33 
 
 
401 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  30.6 
 
 
333 aa  47  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  24.47 
 
 
334 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  23.51 
 
 
827 aa  46.6  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  26.52 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  28.23 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  28.36 
 
 
351 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  28.23 
 
 
616 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  28.37 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  29.86 
 
 
359 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  30.28 
 
 
384 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  25.99 
 
 
311 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 
344 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 
344 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 
344 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  30.08 
 
 
330 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  25.62 
 
 
346 aa  45.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1734  cytochrome c551 peroxidase  26.56 
 
 
271 aa  44.7  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.841983  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  24.38 
 
 
626 aa  44.3  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  29.31 
 
 
338 aa  44.3  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  28.66 
 
 
349 aa  44.3  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  26.99 
 
 
440 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  30.43 
 
 
794 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  28.38 
 
 
459 aa  43.9  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  27.59 
 
 
607 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30 
 
 
821 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
328 aa  43.1  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3026  hypothetical protein  39.29 
 
 
473 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.443921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>