110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2107 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  72.13 
 
 		 467 aa  693    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  69.76 
 
 		 469 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  93.53 
 
 		 467 aa  898    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  69.89 
 
 		 470 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  100 
 
 		 464 aa  952    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  74.68 
 
 		 466 aa  725    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  76.36 
 
 		 465 aa  737    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  69.74 
 
 		 451 aa  622  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  57.7 
 
 		 467 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  58.49 
 
 		 466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  56.84 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  58.47 
 
 		 522 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  54.72 
 
 		 509 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  52.61 
 
 		 513 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  51.9 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  37.04 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  33.04 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  33.86 
 
 		 365 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  35 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  33.33 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  30.11 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  32.38 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  30.11 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  36 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  36 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  32.62 
 
 		 361 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  31.46 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  30.41 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  27.39 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  30.9 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  24.57 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  33.86 
 
 		 358 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  34.78 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  35.16 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  34.35 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  35.19 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  29.55 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  31.06 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  32.2 
 
 		 353 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  31.21 
 
 		 367 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  25.43 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  30.89 
 
 		 343 aa  54.3  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  30.28 
 
 		 346 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  27.45 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  29.77 
 
 		 328 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  25.4 
 
 		 330 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1755  Cytochrome-c peroxidase  28.03 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  28.95 
 
 		 626 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  28.03 
 
 		 371 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.68 
 
 		 652 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  27.61 
 
 		 440 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  28.77 
 
 		 613 aa  50.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  31.71 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  34.65 
 
 		 417 aa  50.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  29.41 
 
 		 337 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  27.13 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  22 
 
 		 341 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  28.68 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  29.77 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  21.91 
 
 		 344 aa  49.3  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  22 
 
 		 341 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  28.67 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 353 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  28.97 
 
 		 328 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  30 
 
 		 360 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  27.87 
 
 		 335 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  28.67 
 
 		 333 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  29.52 
 
 		 521 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  29.37 
 
 		 330 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  28.79 
 
 		 333 aa  47  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3354  di-haem cytochrome c peroxidase  29.01 
 
 		 449 aa  47.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  0.135039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  23.38 
 
 		 592 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  26.96 
 
 		 344 aa  47  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  30.63 
 
 		 794 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  33.64 
 
 		 333 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  27.87 
 
 		 594 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  24.5 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0114  di-haem cytochrome c peroxidase  28.97 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4384  cytochrome-c peroxidase  25.19 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  25.76 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  29.13 
 
 		 594 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  28.1 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  28.47 
 
 		 330 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2749  putative cytochrome c peroxidase  27.92 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0452779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  24.84 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  28.8 
 
 		 297 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  28.08 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  28.85 
 
 		 311 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  27.59 
 
 		 598 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  30.25 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  27.34 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  26.32 
 
 		 343 aa  44.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0518  hypothetical protein  29.79 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3672  di-haem cytochrome c peroxidase  54.84 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  32.43 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2940  hypothetical protein  36.36 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  26.05 
 
 		 424 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  30.95 
 
 		 341 aa  44.3  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  24.67 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5078  hypothetical protein  27.61 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>