More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0577 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  100 
 
 		 652 aa  1347    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  30.4 
 
 		 827 aa  239  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  26.71 
 
 		 1577 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.37 
 
 		 821 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.41 
 
 		 974 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1667 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  30.91 
 
 		 335 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  31.08 
 
 		 1094 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.93 
 
 		 689 aa  124  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  30.34 
 
 		 580 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1291  putative surface layer protein, with cytochrome c domain  24.85 
 
 		 620 aa  120  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.304881  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  29.39 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.76 
 
 		 338 aa  117  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  29.22 
 
 		 329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.73 
 
 		 334 aa  114  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.46 
 
 		 354 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.91 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  30.57 
 
 		 314 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  35.84 
 
 		 819 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  31.2 
 
 		 810 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.82 
 
 		 335 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  29.52 
 
 		 332 aa  109  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.32 
 
 		 1170 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.32 
 
 		 362 aa  108  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.64 
 
 		 324 aa  107  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.97 
 
 		 312 aa  107  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  28.27 
 
 		 387 aa  107  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.24 
 
 		 353 aa  107  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.23 
 
 		 354 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.39 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.39 
 
 		 340 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.39 
 
 		 340 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  27.27 
 
 		 479 aa  106  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.39 
 
 		 340 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.03 
 
 		 354 aa  106  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.96 
 
 		 336 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6221  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.21 
 
 		 810 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.65 
 
 		 329 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.26 
 
 		 347 aa  99.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.42 
 
 		 316 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  23.64 
 
 		 776 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.81 
 
 		 366 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.9 
 
 		 317 aa  98.6  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.77 
 
 		 324 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.81 
 
 		 348 aa  97.8  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  26.9 
 
 		 556 aa  98.2  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.62 
 
 		 332 aa  98.2  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.56 
 
 		 328 aa  97.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 329 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.3 
 
 		 314 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.98 
 
 		 348 aa  95.9  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.9 
 
 		 415 aa  95.9  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.98 
 
 		 328 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.9 
 
 		 451 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.72 
 
 		 314 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.29 
 
 		 334 aa  95.1  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.36 
 
 		 348 aa  95.1  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 329 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.82 
 
 		 517 aa  95.1  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.5 
 
 		 383 aa  94.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.23 
 
 		 326 aa  94.4  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 329 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.54 
 
 		 320 aa  93.2  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.59 
 
 		 344 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  33.5 
 
 		 971 aa  92  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.23 
 
 		 329 aa  91.7  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.58 
 
 		 330 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.73 
 
 		 328 aa  91.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.58 
 
 		 457 aa  90.9  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.41 
 
 		 366 aa  90.5  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.05 
 
 		 328 aa  90.1  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.96 
 
 		 328 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.82 
 
 		 318 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  25.16 
 
 		 312 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.13 
 
 		 327 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.57 
 
 		 327 aa  89  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.76 
 
 		 323 aa  89.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.37 
 
 		 272 aa  88.6  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  30.12 
 
 		 408 aa  88.6  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.84 
 
 		 320 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.65 
 
 		 328 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.39 
 
 		 607 aa  88.2  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.94 
 
 		 311 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  25.24 
 
 		 335 aa  88.2  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.34 
 
 		 311 aa  87  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.05 
 
 		 327 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.67 
 
 		 318 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.95 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.71 
 
 		 370 aa  86.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.65 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.3 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.43 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.24 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.14 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  35.88 
 
 		 250 aa  83.2  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  29.47 
 
 		 1189 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.54 
 
 		 362 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.72 
 
 		 336 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  23.93 
 
 		 334 aa  82.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1705  hypothetical protein  22.36 
 
 		 634 aa  81.6  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>