More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3230 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
517 aa  1043    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.83 
 
 
340 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.83 
 
 
340 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.83 
 
 
340 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  47.52 
 
 
377 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.15 
 
 
348 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.04 
 
 
348 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  43.53 
 
 
348 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.4 
 
 
347 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.43 
 
 
406 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.81 
 
 
366 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.66 
 
 
384 aa  187  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  39.62 
 
 
488 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.5 
 
 
362 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.5 
 
 
362 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.5 
 
 
362 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  34.27 
 
 
819 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.76 
 
 
353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.44 
 
 
1667 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.2 
 
 
354 aa  143  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  32.8 
 
 
1094 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.97 
 
 
689 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  32.7 
 
 
580 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  33.44 
 
 
335 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.1 
 
 
354 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  33.33 
 
 
391 aa  136  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.56 
 
 
752 aa  134  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.77 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.86 
 
 
313 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.51 
 
 
331 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  34.68 
 
 
479 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  37.04 
 
 
272 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.02 
 
 
310 aa  118  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.63 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  31.66 
 
 
332 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 
776 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  36.21 
 
 
314 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.02 
 
 
317 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  38.16 
 
 
810 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.39 
 
 
366 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  29.9 
 
 
1189 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  31.6 
 
 
971 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.94 
 
 
457 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  35.29 
 
 
387 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  28.53 
 
 
335 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.06 
 
 
312 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.1 
 
 
365 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35 
 
 
334 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  31.94 
 
 
556 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.95 
 
 
325 aa  103  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  32.68 
 
 
250 aa  103  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  35.51 
 
 
487 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.84 
 
 
345 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.48 
 
 
328 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.1 
 
 
328 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.62 
 
 
327 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.01 
 
 
329 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.98 
 
 
383 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.51 
 
 
366 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.48 
 
 
366 aa  101  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.71 
 
 
316 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.75 
 
 
323 aa  99.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.24 
 
 
1170 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.85 
 
 
314 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  27.78 
 
 
324 aa  98.2  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3065  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.05 
 
 
356 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1976  hypothetical protein  28.57 
 
 
640 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  50.93 
 
 
134 aa  97.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  27.35 
 
 
324 aa  97.1  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.26 
 
 
338 aa  97.1  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.08 
 
 
336 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.18 
 
 
328 aa  96.3  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  31.19 
 
 
329 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.65 
 
 
607 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.97 
 
 
1056 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.64 
 
 
328 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.82 
 
 
652 aa  95.1  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  51.16 
 
 
147 aa  94.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.38 
 
 
332 aa  94.7  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.08 
 
 
362 aa  94  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.84 
 
 
314 aa  94  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  51.25 
 
 
120 aa  93.6  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.81 
 
 
318 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1516  hypothetical protein  28.57 
 
 
339 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610036  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.04 
 
 
328 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.56 
 
 
330 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2620  hypothetical protein  27.73 
 
 
339 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0272263  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29 
 
 
479 aa  92  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1117  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.03 
 
 
329 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.949748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.21 
 
 
328 aa  91.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.85 
 
 
821 aa  91.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.04 
 
 
328 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.6 
 
 
660 aa  91.3  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6812  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.22 
 
 
363 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.444472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.66 
 
 
336 aa  90.9  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2640  hypothetical protein  29.49 
 
 
330 aa  90.9  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388578  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.53 
 
 
362 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.79 
 
 
324 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2154  hypothetical protein  28.57 
 
 
329 aa  90.1  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>