More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1003 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
312 aa  617  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.45 
 
 
317 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  37.8 
 
 
335 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.04 
 
 
327 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.48 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.36 
 
 
335 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  35.92 
 
 
1094 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  35 
 
 
819 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  35.05 
 
 
1667 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.71 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.69 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.28 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.69 
 
 
362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.45 
 
 
318 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  37.58 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.37 
 
 
328 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.58 
 
 
345 aa  172  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.69 
 
 
324 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.28 
 
 
689 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  35.86 
 
 
353 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.04 
 
 
328 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.16 
 
 
328 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.82 
 
 
330 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.22 
 
 
324 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  35.25 
 
 
580 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.68 
 
 
329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  35.17 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.38 
 
 
329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.25 
 
 
415 aa  166  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.68 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.08 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  36.33 
 
 
332 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.02 
 
 
327 aa  162  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.02 
 
 
321 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  32.93 
 
 
387 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  33.23 
 
 
334 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.45 
 
 
354 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.32 
 
 
334 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  37.4 
 
 
354 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.9 
 
 
332 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.89 
 
 
338 aa  155  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  34.41 
 
 
391 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.11 
 
 
328 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  33.64 
 
 
329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.67 
 
 
752 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.23 
 
 
336 aa  148  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  33.8 
 
 
479 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.23 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.29 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0484  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.18 
 
 
323 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.35 
 
 
329 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.25 
 
 
457 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.67 
 
 
451 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  29.29 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.27 
 
 
314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.45 
 
 
1170 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.53 
 
 
366 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.29 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.92 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 
776 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  29.97 
 
 
810 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.37 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.52 
 
 
328 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.41 
 
 
320 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.79 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.43 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1302  hypothetical protein  30.63 
 
 
364 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.127226  normal  0.259109 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.47 
 
 
347 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.56 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.49 
 
 
357 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.56 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.56 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.56 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  43.98 
 
 
272 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  30.27 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2474  hypothetical protein  32.48 
 
 
364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.686605  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.18 
 
 
357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.31 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  34.43 
 
 
971 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.84 
 
 
383 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.59 
 
 
348 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.96 
 
 
417 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.2 
 
 
318 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.68 
 
 
365 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  39.3 
 
 
314 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5421  WD-40 repeat-containing protein  30.12 
 
 
354 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  46 
 
 
154 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.84 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.88 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.6 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.15 
 
 
310 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.48 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.45 
 
 
311 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.18 
 
 
607 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.92 
 
 
370 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6515  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.61 
 
 
385 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.761865  normal  0.0861969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.93 
 
 
821 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.1 
 
 
325 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.18 
 
 
336 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>