More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1180 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
348 aa  690    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  72.7 
 
 
348 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  70.69 
 
 
348 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  74.71 
 
 
347 aa  500  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.65 
 
 
406 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.19 
 
 
340 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.19 
 
 
340 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.19 
 
 
340 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  46.25 
 
 
377 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.04 
 
 
517 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  39.51 
 
 
366 aa  225  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  41.25 
 
 
488 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.06 
 
 
362 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.75 
 
 
362 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.75 
 
 
362 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  40.13 
 
 
384 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  35.11 
 
 
819 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  34.34 
 
 
1667 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  36.56 
 
 
580 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.16 
 
 
689 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  35.65 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  43.98 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.2 
 
 
752 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  35.67 
 
 
391 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  35.53 
 
 
335 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  38.95 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.44 
 
 
353 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  34.41 
 
 
1094 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.09 
 
 
366 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  33.91 
 
 
387 aa  156  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  33.74 
 
 
810 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  36.79 
 
 
971 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.66 
 
 
331 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.58 
 
 
328 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.31 
 
 
451 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  36.8 
 
 
332 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.38 
 
 
318 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.44 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.2 
 
 
317 aa  135  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.5 
 
 
1170 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.29 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.48 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.17 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  39.62 
 
 
272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.96 
 
 
417 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  29.03 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.03 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.45 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.7 
 
 
362 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
776 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.41 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.9 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.7 
 
 
362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.28 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  30.79 
 
 
329 aa  126  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.39 
 
 
330 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.79 
 
 
320 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31 
 
 
324 aa  126  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  29.88 
 
 
479 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  36.36 
 
 
556 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  36.18 
 
 
306 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.79 
 
 
335 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  36.76 
 
 
1189 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  30.87 
 
 
487 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  37.14 
 
 
314 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.29 
 
 
313 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.6 
 
 
365 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.01 
 
 
305 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.7 
 
 
327 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.55 
 
 
338 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.96 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  28.11 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.46 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.27 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.14 
 
 
366 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.87 
 
 
311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  28.31 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.52 
 
 
328 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.71 
 
 
345 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.76 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.82 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.88 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.18 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.15 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.22 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.78 
 
 
329 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.23 
 
 
336 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.82 
 
 
336 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.78 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 
660 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.3 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.23 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  33.05 
 
 
250 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  23.66 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.93 
 
 
334 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.57 
 
 
328 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.85 
 
 
329 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1976  hypothetical protein  30.12 
 
 
640 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6812  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.47 
 
 
363 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.444472  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.21 
 
 
321 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>