More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5454 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 
1189 aa  2351    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  42.67 
 
 
877 aa  595  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  41.42 
 
 
1084 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  42.73 
 
 
890 aa  527  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  42.28 
 
 
955 aa  482  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  42.28 
 
 
955 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  42.15 
 
 
986 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  42.28 
 
 
986 aa  482  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  42.28 
 
 
986 aa  482  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  42.28 
 
 
986 aa  482  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  42.47 
 
 
964 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  42.3 
 
 
986 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  41.49 
 
 
961 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  38.59 
 
 
827 aa  467  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  39.81 
 
 
899 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  40.39 
 
 
819 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  40.39 
 
 
819 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  40.39 
 
 
819 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  39.02 
 
 
811 aa  452  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  34.92 
 
 
1089 aa  452  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  40.05 
 
 
823 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  36.73 
 
 
1075 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.9 
 
 
846 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  36.32 
 
 
839 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.33 
 
 
849 aa  415  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  39.3 
 
 
1465 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.42 
 
 
784 aa  372  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  35.32 
 
 
777 aa  370  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  33.25 
 
 
785 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.82 
 
 
807 aa  367  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  29.96 
 
 
976 aa  350  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  31.95 
 
 
771 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  30.94 
 
 
761 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  34.48 
 
 
784 aa  340  7e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  30.6 
 
 
749 aa  339  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  33.58 
 
 
821 aa  338  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  31.01 
 
 
762 aa  338  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  33.16 
 
 
747 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  31.23 
 
 
775 aa  334  7.000000000000001e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  30.49 
 
 
747 aa  331  6e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  29.54 
 
 
778 aa  330  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  30.17 
 
 
753 aa  330  8e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.36 
 
 
771 aa  328  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  31.27 
 
 
769 aa  328  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  30.9 
 
 
759 aa  326  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  30.41 
 
 
757 aa  323  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  31.85 
 
 
740 aa  322  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  36.53 
 
 
754 aa  320  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  28.82 
 
 
772 aa  317  7e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  29.57 
 
 
774 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  27.94 
 
 
780 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  29.1 
 
 
782 aa  312  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  28.85 
 
 
758 aa  311  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  27.54 
 
 
759 aa  308  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  30.88 
 
 
706 aa  306  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  32.03 
 
 
773 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  30.27 
 
 
745 aa  302  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  31.23 
 
 
760 aa  299  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.84 
 
 
771 aa  298  6e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  28.62 
 
 
795 aa  293  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.7 
 
 
769 aa  291  6e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.16 
 
 
900 aa  290  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  32.16 
 
 
900 aa  290  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  28.41 
 
 
818 aa  288  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  28.09 
 
 
818 aa  287  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  30.18 
 
 
742 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  29.37 
 
 
728 aa  280  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  27.81 
 
 
760 aa  278  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  26.75 
 
 
797 aa  277  8e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  31.11 
 
 
886 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.11 
 
 
886 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  31.11 
 
 
886 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  31.21 
 
 
751 aa  275  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  27.91 
 
 
755 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  29.14 
 
 
754 aa  272  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  30.31 
 
 
790 aa  273  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.96 
 
 
741 aa  272  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  30.63 
 
 
888 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  30.1 
 
 
808 aa  270  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  29.85 
 
 
806 aa  268  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  29.66 
 
 
790 aa  266  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7541  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31.84 
 
 
900 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.439325 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  28.68 
 
 
826 aa  259  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.86 
 
 
753 aa  258  5e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.83 
 
 
781 aa  257  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  28.43 
 
 
826 aa  255  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  28.02 
 
 
751 aa  255  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  27.53 
 
 
943 aa  254  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  27.76 
 
 
1124 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  27.26 
 
 
716 aa  239  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  26.87 
 
 
917 aa  237  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  27.65 
 
 
901 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  26.34 
 
 
901 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  30.4 
 
 
771 aa  235  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  26 
 
 
757 aa  234  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  27.96 
 
 
1426 aa  232  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  27.7 
 
 
764 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  26.79 
 
 
768 aa  225  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  27.58 
 
 
1114 aa  222  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  26.63 
 
 
1427 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>