116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0304 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  43.49 
 
 		 742 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  64.85 
 
 		 747 aa  1005    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  47.11 
 
 		 751 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 773 aa  1597    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  46.82 
 
 		 747 aa  678    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  43.79 
 
 		 753 aa  635    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  44.09 
 
 		 754 aa  649    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  42.33 
 
 		 759 aa  634  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  46.23 
 
 		 784 aa  620  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  44.09 
 
 		 706 aa  615  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  41.33 
 
 		 761 aa  613  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  42.34 
 
 		 976 aa  610  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  43.58 
 
 		 785 aa  592  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  40.68 
 
 		 771 aa  587  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  42.86 
 
 		 784 aa  588  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  42.22 
 
 		 807 aa  579  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  40.45 
 
 		 790 aa  552  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  40.39 
 
 		 790 aa  548  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  41.41 
 
 		 777 aa  534  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  37.87 
 
 		 778 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  39.36 
 
 		 775 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  39.17 
 
 		 769 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  37.87 
 
 		 762 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  39.17 
 
 		 741 aa  497  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  37.65 
 
 		 826 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  37.94 
 
 		 826 aa  485  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  39.65 
 
 		 769 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  34.95 
 
 		 888 aa  465  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  35.39 
 
 		 818 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  35.27 
 
 		 818 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  34.42 
 
 		 886 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  34.42 
 
 		 886 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  34.42 
 
 		 886 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  33.65 
 
 		 943 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  36.31 
 
 		 806 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  35.22 
 
 		 827 aa  418  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  35.57 
 
 		 808 aa  415  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  33.08 
 
 		 772 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  32.73 
 
 		 771 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  32.43 
 
 		 757 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  32.18 
 
 		 782 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  31.28 
 
 		 901 aa  379  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  33.55 
 
 		 760 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  32.19 
 
 		 780 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  32.76 
 
 		 749 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  31.18 
 
 		 917 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  33.63 
 
 		 1089 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  32.9 
 
 		 745 aa  369  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  32.45 
 
 		 759 aa  365  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  32.39 
 
 		 760 aa  365  1e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  30.78 
 
 		 774 aa  360  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  32.82 
 
 		 716 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 		 740 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  30.92 
 
 		 758 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  32.94 
 
 		 1075 aa  352  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  33.11 
 
 		 755 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.82 
 
 		 781 aa  347  5e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  32.54 
 
 		 877 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  33.38 
 
 		 899 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  30.93 
 
 		 1084 aa  328  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.39 
 
 		 771 aa  324  5e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.92 
 
 		 964 aa  318  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.69 
 
 		 961 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  29.25 
 
 		 821 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  29.85 
 
 		 986 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  31.1 
 
 		 811 aa  311  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  30.42 
 
 		 795 aa  310  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.85 
 
 		 986 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.85 
 
 		 986 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  29.85 
 
 		 986 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.85 
 
 		 986 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.85 
 
 		 955 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.72 
 
 		 955 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  28.8 
 
 		 768 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  31.44 
 
 		 771 aa  300  6e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  32.08 
 
 		 1189 aa  299  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  28.21 
 
 		 797 aa  297  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  28.95 
 
 		 728 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  29.49 
 
 		 890 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  27.93 
 
 		 757 aa  282  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  29.52 
 
 		 751 aa  280  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.87 
 
 		 823 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.13 
 
 		 819 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  30.13 
 
 		 819 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  30.13 
 
 		 819 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.23 
 
 		 912 aa  269  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.75 
 
 		 846 aa  266  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.97 
 
 		 753 aa  262  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  29.42 
 
 		 764 aa  260  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  28.29 
 
 		 1124 aa  258  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  27.37 
 
 		 1114 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  30.48 
 
 		 754 aa  248  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.75 
 
 		 849 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  28.79 
 
 		 839 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  27.37 
 
 		 901 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  28.61 
 
 		 1426 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.79 
 
 		 1322 aa  233  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06597  alpha-1,2-mannosidase  32.69 
 
 		 534 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  26.73 
 
 		 1427 aa  228  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06593  alpha-1,2-mannosidase  37.65 
 
 		 436 aa  227  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>