116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6816 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  49.41 
 
 		 807 aa  739    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  47.67 
 
 		 785 aa  716    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  48.13 
 
 		 784 aa  718    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  68.77 
 
 		 778 aa  1132    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  46.57 
 
 		 777 aa  687    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  50.54 
 
 		 784 aa  734    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  69.66 
 
 		 775 aa  1115    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  67.63 
 
 		 762 aa  1113    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 769 aa  1617    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  42.99 
 
 		 759 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  41.8 
 
 		 761 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  43.52 
 
 		 753 aa  596  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  43.34 
 
 		 742 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  42.33 
 
 		 771 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  42.12 
 
 		 747 aa  575  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  41.47 
 
 		 976 aa  568  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  41.92 
 
 		 754 aa  563  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  43.94 
 
 		 751 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  39.97 
 
 		 747 aa  548  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  39.39 
 
 		 790 aa  515  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  39.09 
 
 		 773 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  39.39 
 
 		 790 aa  509  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  39.92 
 
 		 706 aa  500  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  39.12 
 
 		 769 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  38.37 
 
 		 741 aa  490  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  37.02 
 
 		 757 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  35.61 
 
 		 827 aa  444  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  35.84 
 
 		 818 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  36.21 
 
 		 818 aa  435  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  34.26 
 
 		 774 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  35.28 
 
 		 806 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  34.6 
 
 		 808 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  34.69 
 
 		 758 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  33.66 
 
 		 826 aa  415  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 		 826 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  34.44 
 
 		 759 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  33.71 
 
 		 943 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  32.58 
 
 		 780 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  34.79 
 
 		 760 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.37 
 
 		 886 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  32.37 
 
 		 886 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  34.11 
 
 		 782 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  32.37 
 
 		 886 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  33.16 
 
 		 1089 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  32.42 
 
 		 772 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  33.51 
 
 		 740 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  31.11 
 
 		 917 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  31.25 
 
 		 901 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31.94 
 
 		 888 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  32.94 
 
 		 760 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  33.51 
 
 		 771 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  33.8 
 
 		 755 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  33.47 
 
 		 749 aa  376  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  32.82 
 
 		 1075 aa  365  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  32.28 
 
 		 797 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.38 
 
 		 771 aa  348  3e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  32.07 
 
 		 745 aa  341  4e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  32.91 
 
 		 764 aa  334  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  30.17 
 
 		 821 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.01 
 
 		 781 aa  330  6e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  31.74 
 
 		 877 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  29.27 
 
 		 1084 aa  327  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  32.09 
 
 		 986 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.09 
 
 		 964 aa  323  8e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  31.61 
 
 		 986 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.96 
 
 		 955 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31.6 
 
 		 961 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.83 
 
 		 955 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.83 
 
 		 986 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.83 
 
 		 986 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.83 
 
 		 986 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  31.27 
 
 		 1189 aa  321  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  29.85 
 
 		 795 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  30.99 
 
 		 899 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  30.78 
 
 		 716 aa  313  9e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  28.4 
 
 		 757 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  29.86 
 
 		 728 aa  306  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  32 
 
 		 819 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  32 
 
 		 819 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  32 
 
 		 819 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31 
 
 		 823 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  35.66 
 
 		 751 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  29.15 
 
 		 768 aa  298  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  30.43 
 
 		 811 aa  295  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.61 
 
 		 846 aa  263  8e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  28.23 
 
 		 890 aa  263  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  28.37 
 
 		 1426 aa  263  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.21 
 
 		 849 aa  259  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  28.55 
 
 		 771 aa  257  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  29.4 
 
 		 754 aa  254  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  27.28 
 
 		 1124 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.14 
 
 		 753 aa  252  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.64 
 
 		 1322 aa  252  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  27.43 
 
 		 839 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  27.19 
 
 		 901 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  26.43 
 
 		 798 aa  239  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.71 
 
 		 912 aa  239  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.45 
 
 		 900 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  26.45 
 
 		 900 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06597  alpha-1,2-mannosidase  34.38 
 
 		 534 aa  236  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>