137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2599 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  100 
 
 
1322 aa  2690    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  57.79 
 
 
1124 aa  1230    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  61.61 
 
 
1427 aa  1565    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  61.98 
 
 
1422 aa  1555    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  52.89 
 
 
1114 aa  1116    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  45.39 
 
 
1053 aa  770    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  59.22 
 
 
1426 aa  1517    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  43.65 
 
 
1073 aa  802    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14540  alpha-1,2-mannosidase, putative  38.13 
 
 
1034 aa  551  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254996  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  36.31 
 
 
780 aa  489  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  35.54 
 
 
772 aa  475  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  35.01 
 
 
774 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  34.69 
 
 
758 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  34.99 
 
 
759 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  33.55 
 
 
782 aa  429  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  33.77 
 
 
760 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  34.16 
 
 
755 aa  403  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.77 
 
 
781 aa  386  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1609  alpha-1,2-mannosidase  27.84 
 
 
701 aa  303  1e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.66 
 
 
827 aa  292  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  25.59 
 
 
976 aa  290  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  28.43 
 
 
754 aa  284  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  27.26 
 
 
747 aa  277  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  27.76 
 
 
759 aa  275  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  27.2 
 
 
753 aa  274  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.97 
 
 
807 aa  273  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  28.41 
 
 
742 aa  273  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  27.9 
 
 
771 aa  270  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  28.86 
 
 
771 aa  268  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  30.12 
 
 
1075 aa  263  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  26.45 
 
 
778 aa  260  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  27.53 
 
 
762 aa  258  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  28.39 
 
 
751 aa  258  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  26.87 
 
 
761 aa  257  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  27.94 
 
 
784 aa  255  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  26.64 
 
 
769 aa  254  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  27.81 
 
 
1089 aa  254  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  27.68 
 
 
986 aa  253  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.55 
 
 
955 aa  252  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  27.55 
 
 
986 aa  252  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.55 
 
 
955 aa  251  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.55 
 
 
986 aa  251  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.55 
 
 
986 aa  251  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.55 
 
 
986 aa  251  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  27.7 
 
 
775 aa  251  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  28.5 
 
 
751 aa  250  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.77 
 
 
741 aa  249  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.85 
 
 
771 aa  249  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.68 
 
 
964 aa  248  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.44 
 
 
912 aa  246  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  28.42 
 
 
728 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  28.57 
 
 
1084 aa  243  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  27.25 
 
 
961 aa  242  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  26.3 
 
 
706 aa  241  6.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  26 
 
 
716 aa  241  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  27.26 
 
 
785 aa  240  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  28.85 
 
 
811 aa  240  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  25.58 
 
 
795 aa  240  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  29.16 
 
 
790 aa  237  9e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  26.7 
 
 
773 aa  235  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.82 
 
 
769 aa  235  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.3 
 
 
753 aa  235  5e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  26.74 
 
 
747 aa  235  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.77 
 
 
784 aa  235  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  25.09 
 
 
757 aa  231  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  27.02 
 
 
839 aa  228  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  25.23 
 
 
797 aa  228  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  28.23 
 
 
790 aa  228  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  25.81 
 
 
760 aa  227  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.15 
 
 
849 aa  226  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  28.21 
 
 
877 aa  226  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.07 
 
 
846 aa  225  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  27.1 
 
 
777 aa  224  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  25.89 
 
 
943 aa  223  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  26.39 
 
 
890 aa  219  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  28.52 
 
 
740 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  26.72 
 
 
899 aa  214  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  26.03 
 
 
1189 aa  212  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  26.73 
 
 
768 aa  210  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  27.93 
 
 
821 aa  208  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  24.45 
 
 
749 aa  205  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  25 
 
 
888 aa  201  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  26.04 
 
 
823 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  25.99 
 
 
802 aa  198  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  24.79 
 
 
757 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  25.46 
 
 
826 aa  196  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.04 
 
 
771 aa  194  7e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  26.03 
 
 
798 aa  194  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  25.31 
 
 
826 aa  194  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.01 
 
 
819 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  26.01 
 
 
819 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  26.01 
 
 
819 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  24.29 
 
 
764 aa  192  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  25.73 
 
 
818 aa  191  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  24.86 
 
 
745 aa  189  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  25.15 
 
 
818 aa  187  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  27 
 
 
1465 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  25.03 
 
 
901 aa  182  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  26.74 
 
 
808 aa  181  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03054  alpha-1,2-mannosidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10520)  25.69 
 
 
821 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>