116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0289 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  66.05 
 
 		 742 aa  1050    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  47.14 
 
 		 747 aa  671    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 751 aa  1560    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  46.43 
 
 		 773 aa  651    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  44.62 
 
 		 747 aa  629  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  41.66 
 
 		 761 aa  609  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  46.05 
 
 		 784 aa  597  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  43.92 
 
 		 759 aa  596  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  42.8 
 
 		 754 aa  593  1e-168  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  43.22 
 
 		 706 aa  595  1e-168  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  43.89 
 
 		 785 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  41.16 
 
 		 753 aa  581  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  44.31 
 
 		 784 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  43.72 
 
 		 775 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  43.36 
 
 		 777 aa  572  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  42.04 
 
 		 976 aa  572  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  41.4 
 
 		 762 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  41.58 
 
 		 778 aa  565  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  41.6 
 
 		 807 aa  565  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  42.6 
 
 		 771 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  42.69 
 
 		 769 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  43.29 
 
 		 741 aa  558  1e-157  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  41.45 
 
 		 790 aa  509  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  41.31 
 
 		 790 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  37.49 
 
 		 818 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  37.37 
 
 		 818 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  38.42 
 
 		 806 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  38.16 
 
 		 808 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  35.1 
 
 		 943 aa  451  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  35.55 
 
 		 826 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  39.64 
 
 		 769 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  35.29 
 
 		 826 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  37.48 
 
 		 827 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  34.31 
 
 		 886 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  34.31 
 
 		 886 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  34.31 
 
 		 886 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  34.27 
 
 		 888 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  34.36 
 
 		 772 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  33.64 
 
 		 757 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  31.41 
 
 		 901 aa  382  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  31.19 
 
 		 917 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  33.04 
 
 		 782 aa  372  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  32.21 
 
 		 760 aa  372  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  33.33 
 
 		 774 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  33.46 
 
 		 1089 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  33.38 
 
 		 758 aa  362  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  31.57 
 
 		 760 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  32.61 
 
 		 759 aa  362  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  31.25 
 
 		 780 aa  360  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  33.64 
 
 		 755 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  31.07 
 
 		 771 aa  351  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  33.51 
 
 		 1075 aa  347  7e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.42 
 
 		 964 aa  344  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  33.38 
 
 		 986 aa  343  9e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.03 
 
 		 955 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.03 
 
 		 955 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  32.45 
 
 		 740 aa  342  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.03 
 
 		 986 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.03 
 
 		 986 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  34.03 
 
 		 986 aa  342  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.03 
 
 		 986 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.54 
 
 		 781 aa  341  2.9999999999999998e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  32.2 
 
 		 716 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  32.61 
 
 		 961 aa  327  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  30.55 
 
 		 749 aa  326  8.000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  29.85 
 
 		 745 aa  326  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  32.84 
 
 		 877 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  28.96 
 
 		 757 aa  317  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.46 
 
 		 771 aa  317  8e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  31.27 
 
 		 821 aa  310  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  29.9 
 
 		 795 aa  297  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  29.32 
 
 		 768 aa  290  6e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  32.47 
 
 		 899 aa  290  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  30.14 
 
 		 1084 aa  290  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  30.75 
 
 		 797 aa  280  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.62 
 
 		 819 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  30.62 
 
 		 819 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  30.62 
 
 		 819 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  28.42 
 
 		 728 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  29.46 
 
 		 890 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  29.78 
 
 		 751 aa  270  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.27 
 
 		 823 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  31.35 
 
 		 1189 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  28.95 
 
 		 1124 aa  266  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  29.62 
 
 		 764 aa  264  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  29.67 
 
 		 811 aa  259  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.39 
 
 		 1322 aa  257  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.01 
 
 		 846 aa  254  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  32.75 
 
 		 754 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.99 
 
 		 753 aa  253  7e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  29.25 
 
 		 1426 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06597  alpha-1,2-mannosidase  33.84 
 
 		 534 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  34.71 
 
 		 771 aa  246  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.54 
 
 		 849 aa  244  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.15 
 
 		 900 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  27.15 
 
 		 900 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.39 
 
 		 912 aa  241  4e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  30.21 
 
 		 1053 aa  237  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  26.5 
 
 		 1114 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1609  alpha-1,2-mannosidase  28.47 
 
 		 701 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>