116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0288 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  48.98 
 
 		 771 aa  708    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  66.25 
 
 		 760 aa  1030    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 740 aa  1529    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  50.97 
 
 		 749 aa  740    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  49.24 
 
 		 745 aa  705    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  37.68 
 
 		 827 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.16 
 
 		 807 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  34.52 
 
 		 785 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  32.65 
 
 		 762 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  33.25 
 
 		 775 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.15 
 
 		 784 aa  399  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  32.32 
 
 		 778 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  34.87 
 
 		 1075 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  33.86 
 
 		 753 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  34.92 
 
 		 784 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  34.08 
 
 		 769 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  34.79 
 
 		 747 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  33.81 
 
 		 754 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  34.62 
 
 		 747 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  33.55 
 
 		 706 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  32.13 
 
 		 759 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  32.44 
 
 		 761 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  32.53 
 
 		 742 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  32.99 
 
 		 757 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  34.22 
 
 		 777 aa  363  5.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  32.84 
 
 		 773 aa  359  9e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  31.46 
 
 		 976 aa  357  2.9999999999999997e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  31.98 
 
 		 1089 aa  353  8.999999999999999e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  32.45 
 
 		 751 aa  350  6e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  32.33 
 
 		 771 aa  342  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.82 
 
 		 771 aa  340  7e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  32.06 
 
 		 795 aa  340  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  32.9 
 
 		 772 aa  336  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  32.25 
 
 		 1084 aa  333  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  33.03 
 
 		 782 aa  328  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.17 
 
 		 819 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  32.17 
 
 		 819 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  32.17 
 
 		 819 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  33.07 
 
 		 899 aa  323  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  33.47 
 
 		 877 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31.4 
 
 		 823 aa  320  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  31.62 
 
 		 797 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  30.78 
 
 		 986 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  30.69 
 
 		 780 aa  317  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.63 
 
 		 769 aa  316  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.78 
 
 		 955 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  31.9 
 
 		 1189 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.78 
 
 		 955 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.69 
 
 		 964 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  31 
 
 		 986 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  31 
 
 		 986 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  30.78 
 
 		 986 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  31 
 
 		 986 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  30.75 
 
 		 961 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  32.1 
 
 		 790 aa  313  4.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  31.83 
 
 		 790 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  31.09 
 
 		 821 aa  308  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.53 
 
 		 741 aa  304  4.0000000000000003e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  29.63 
 
 		 757 aa  303  7.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  32.37 
 
 		 811 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  30.32 
 
 		 826 aa  303  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  30.08 
 
 		 808 aa  299  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  30.2 
 
 		 826 aa  299  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  30.08 
 
 		 806 aa  298  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  30.33 
 
 		 758 aa  297  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  29.27 
 
 		 728 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.14 
 
 		 846 aa  287  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  30.31 
 
 		 751 aa  286  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  29.15 
 
 		 716 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  29.51 
 
 		 818 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  29.76 
 
 		 774 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  28.48 
 
 		 760 aa  285  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  29.54 
 
 		 818 aa  284  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.7 
 
 		 886 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  31.66 
 
 		 839 aa  280  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  27.7 
 
 		 886 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.26 
 
 		 849 aa  280  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  27.7 
 
 		 886 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  28.72 
 
 		 759 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  28.82 
 
 		 943 aa  277  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  35.8 
 
 		 1465 aa  274  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  28.79 
 
 		 755 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  29.82 
 
 		 890 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  28.18 
 
 		 764 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  29.27 
 
 		 768 aa  265  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.53 
 
 		 781 aa  264  4e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  26.47 
 
 		 888 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.26 
 
 		 753 aa  252  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  27.07 
 
 		 901 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  30.39 
 
 		 754 aa  247  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  27.96 
 
 		 798 aa  246  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  26.84 
 
 		 917 aa  245  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  28.12 
 
 		 901 aa  244  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  28.97 
 
 		 1426 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  27.39 
 
 		 802 aa  234  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  28.21 
 
 		 1422 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  27.75 
 
 		 1427 aa  226  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  33.27 
 
 		 771 aa  224  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  29.23 
 
 		 1124 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  25.62 
 
 		 1322 aa  213  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>