116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4742 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 771 aa  1612    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  34.28 
 
 		 780 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  34.58 
 
 		 758 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  33.62 
 
 		 772 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  34.08 
 
 		 774 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  35.26 
 
 		 782 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  33.33 
 
 		 976 aa  421  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.03 
 
 		 807 aa  415  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  33.81 
 
 		 785 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  33.42 
 
 		 759 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.42 
 
 		 784 aa  412  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  33.33 
 
 		 757 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  33.66 
 
 		 777 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  34.76 
 
 		 747 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  33 
 
 		 753 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  33.46 
 
 		 784 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  33.46 
 
 		 755 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  32.57 
 
 		 747 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  31.7 
 
 		 754 aa  386  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  32.6 
 
 		 773 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  33.51 
 
 		 769 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 		 762 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  32.32 
 
 		 742 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  32.84 
 
 		 759 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  32.04 
 
 		 761 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  32.74 
 
 		 760 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.7 
 
 		 781 aa  372  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  32.68 
 
 		 1089 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  31.47 
 
 		 778 aa  355  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  31.87 
 
 		 749 aa  353  8e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  31.34 
 
 		 775 aa  351  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  31.07 
 
 		 751 aa  350  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.28 
 
 		 771 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  33.58 
 
 		 751 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.72 
 
 		 827 aa  348  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  31.17 
 
 		 877 aa  347  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.02 
 
 		 769 aa  345  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  32.06 
 
 		 790 aa  344  2.9999999999999997e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  32.76 
 
 		 1075 aa  343  9e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  32.1 
 
 		 790 aa  339  9e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  32.79 
 
 		 728 aa  339  9e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  31.93 
 
 		 740 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  31.56 
 
 		 760 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  31.95 
 
 		 1189 aa  337  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  31.52 
 
 		 986 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  31.52 
 
 		 986 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.92 
 
 		 741 aa  328  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.52 
 
 		 955 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.52 
 
 		 955 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.52 
 
 		 986 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.52 
 
 		 986 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.52 
 
 		 986 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  31.25 
 
 		 745 aa  328  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  31.67 
 
 		 706 aa  328  3e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.29 
 
 		 964 aa  324  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  30.68 
 
 		 797 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.34 
 
 		 912 aa  320  7e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  31.59 
 
 		 1084 aa  319  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  32.05 
 
 		 771 aa  318  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.13 
 
 		 753 aa  318  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  30.95 
 
 		 716 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  31.75 
 
 		 811 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.64 
 
 		 846 aa  310  6.999999999999999e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  29.61 
 
 		 795 aa  307  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.51 
 
 		 771 aa  306  9.000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.51 
 
 		 961 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  31.75 
 
 		 899 aa  300  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  30.76 
 
 		 1426 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  28.85 
 
 		 839 aa  295  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  30.25 
 
 		 1124 aa  293  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.55 
 
 		 849 aa  292  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.59 
 
 		 823 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  27.92 
 
 		 888 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.26 
 
 		 819 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  30.26 
 
 		 819 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  30.26 
 
 		 819 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  28.66 
 
 		 821 aa  284  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.05 
 
 		 886 aa  283  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  28.05 
 
 		 886 aa  283  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  28.05 
 
 		 886 aa  283  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  28.2 
 
 		 943 aa  283  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  28.41 
 
 		 818 aa  281  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  29.34 
 
 		 1114 aa  279  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  28.29 
 
 		 818 aa  279  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  27.48 
 
 		 757 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  29.06 
 
 		 764 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.65 
 
 		 1322 aa  264  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  28.13 
 
 		 826 aa  264  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  27.76 
 
 		 1427 aa  257  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  28.29 
 
 		 826 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  27.04 
 
 		 802 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  27.97 
 
 		 1422 aa  253  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  26.78 
 
 		 808 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  26.69 
 
 		 806 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  27.6 
 
 		 768 aa  248  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  27.32 
 
 		 890 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  32.56 
 
 		 1465 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  25.37 
 
 		 901 aa  228  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  25.37 
 
 		 917 aa  228  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  26.31 
 
 		 798 aa  225  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>