116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0761 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 
901 aa  1865    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  39.97 
 
 
797 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  38.97 
 
 
795 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  37.94 
 
 
768 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  31.55 
 
 
764 aa  364  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  30.27 
 
 
747 aa  309  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  28.81 
 
 
757 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  28.28 
 
 
774 aa  284  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  29.66 
 
 
754 aa  274  5.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  27.59 
 
 
785 aa  271  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.58 
 
 
784 aa  270  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  28.17 
 
 
759 aa  267  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  28.05 
 
 
762 aa  266  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  28.03 
 
 
753 aa  266  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  28.86 
 
 
761 aa  264  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.35 
 
 
827 aa  262  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  29.05 
 
 
758 aa  257  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  29.44 
 
 
1075 aa  257  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  29.46 
 
 
749 aa  255  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  26.62 
 
 
778 aa  254  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.88 
 
 
807 aa  253  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  26.95 
 
 
780 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  28.82 
 
 
759 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  28.89 
 
 
747 aa  250  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  28.77 
 
 
782 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  27.78 
 
 
775 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.86 
 
 
771 aa  247  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  27.8 
 
 
772 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  27.26 
 
 
760 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  26.61 
 
 
976 aa  242  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  27.19 
 
 
769 aa  241  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  27.09 
 
 
773 aa  238  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  28.44 
 
 
1089 aa  238  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  27.84 
 
 
742 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  28.05 
 
 
790 aa  233  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.66 
 
 
771 aa  233  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  28.27 
 
 
740 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  27.02 
 
 
706 aa  231  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  26.61 
 
 
784 aa  230  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  26.79 
 
 
888 aa  227  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  26.69 
 
 
716 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  27.42 
 
 
760 aa  226  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  26.56 
 
 
728 aa  225  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  27 
 
 
745 aa  225  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  27.39 
 
 
1189 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  26.14 
 
 
771 aa  222  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  27.66 
 
 
790 aa  220  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.91 
 
 
886 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  26.91 
 
 
886 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  26.91 
 
 
886 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  27.63 
 
 
777 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  26.89 
 
 
811 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  25.06 
 
 
1084 aa  216  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  27.32 
 
 
751 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  26.6 
 
 
877 aa  213  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  26.34 
 
 
755 aa  213  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.1 
 
 
769 aa  211  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  25.46 
 
 
826 aa  209  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  27.09 
 
 
751 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  25.55 
 
 
826 aa  207  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  26.91 
 
 
961 aa  204  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.18 
 
 
781 aa  203  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  26.79 
 
 
943 aa  203  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  26.65 
 
 
808 aa  200  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.49 
 
 
753 aa  200  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  26.22 
 
 
806 aa  198  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  26.73 
 
 
899 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  24.36 
 
 
818 aa  194  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  24.44 
 
 
757 aa  193  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  24.24 
 
 
818 aa  191  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  26.45 
 
 
986 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  26.59 
 
 
986 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  25.6 
 
 
890 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.59 
 
 
955 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.45 
 
 
986 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.45 
 
 
986 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.45 
 
 
986 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.45 
 
 
955 aa  188  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.84 
 
 
741 aa  186  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.77 
 
 
964 aa  185  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  26.13 
 
 
823 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  25.03 
 
 
1322 aa  181  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.56 
 
 
819 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  26.56 
 
 
819 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  26.56 
 
 
819 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  24.89 
 
 
1427 aa  174  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  28.09 
 
 
1465 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  24.76 
 
 
1124 aa  170  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  26.14 
 
 
1426 aa  170  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.97 
 
 
846 aa  167  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  23.19 
 
 
802 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  24.79 
 
 
1422 aa  161  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  23 
 
 
821 aa  161  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  23.87 
 
 
1114 aa  159  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.93 
 
 
849 aa  153  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  25.23 
 
 
839 aa  152  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  22.87 
 
 
798 aa  145  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  24.26 
 
 
754 aa  138  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  23.36 
 
 
901 aa  137  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  25.68 
 
 
1073 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>