116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3359 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 728 aa  1515    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  64.01 
 
 		 751 aa  985    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  44.85 
 
 		 753 aa  629  1e-179  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  32.31 
 
 		 747 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  31.72 
 
 		 761 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  31.68 
 
 		 754 aa  343  5e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.87 
 
 		 784 aa  342  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  30.7 
 
 		 771 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  32.4 
 
 		 782 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  30.84 
 
 		 747 aa  334  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  30.2 
 
 		 785 aa  334  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  31.59 
 
 		 976 aa  329  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  37.5 
 
 		 807 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  30.77 
 
 		 780 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  33.92 
 
 		 755 aa  327  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  31.71 
 
 		 772 aa  323  7e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.22 
 
 		 771 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  30.12 
 
 		 778 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  30.73 
 
 		 757 aa  322  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  30.6 
 
 		 758 aa  320  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  31.32 
 
 		 759 aa  317  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  30.23 
 
 		 753 aa  313  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  29.61 
 
 		 769 aa  310  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  32.44 
 
 		 775 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  31.31 
 
 		 774 aa  303  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  30.28 
 
 		 784 aa  303  8.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  31.28 
 
 		 706 aa  302  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  29.57 
 
 		 762 aa  297  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  29.33 
 
 		 742 aa  296  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  31.73 
 
 		 760 aa  296  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  28.5 
 
 		 773 aa  294  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  28.99 
 
 		 740 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.2 
 
 		 781 aa  285  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  30.54 
 
 		 759 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  28.46 
 
 		 790 aa  279  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  29.07 
 
 		 749 aa  275  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  28.42 
 
 		 751 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  30.35 
 
 		 795 aa  272  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.77 
 
 		 769 aa  270  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  28.74 
 
 		 1189 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  28.06 
 
 		 790 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  28.47 
 
 		 1075 aa  266  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  28.55 
 
 		 760 aa  266  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  27.66 
 
 		 1089 aa  264  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.47 
 
 		 961 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  29.68 
 
 		 745 aa  261  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  28.61 
 
 		 797 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  29.04 
 
 		 777 aa  260  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  27.32 
 
 		 716 aa  257  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.48 
 
 		 827 aa  257  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  27.99 
 
 		 826 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  29.64 
 
 		 1426 aa  255  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.61 
 
 		 741 aa  253  7e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.88 
 
 		 886 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  26.88 
 
 		 886 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  26.88 
 
 		 886 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  27.56 
 
 		 888 aa  251  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.36 
 
 		 771 aa  250  7e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  27.35 
 
 		 757 aa  249  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  27.08 
 
 		 826 aa  249  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  27.52 
 
 		 877 aa  248  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  27.51 
 
 		 1124 aa  244  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.42 
 
 		 1322 aa  243  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  27.84 
 
 		 818 aa  242  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  27.93 
 
 		 818 aa  242  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  27.61 
 
 		 764 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  26.04 
 
 		 943 aa  238  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  27.85 
 
 		 811 aa  238  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.25 
 
 		 964 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  28.96 
 
 		 768 aa  233  8.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  27.04 
 
 		 1114 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  27.03 
 
 		 986 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.9 
 
 		 955 aa  231  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.9 
 
 		 955 aa  230  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.9 
 
 		 986 aa  230  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.9 
 
 		 986 aa  230  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  26.54 
 
 		 986 aa  230  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.9 
 
 		 986 aa  230  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  27.56 
 
 		 1427 aa  228  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  27.09 
 
 		 808 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  27.09 
 
 		 806 aa  226  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  26.56 
 
 		 901 aa  225  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  27.13 
 
 		 1422 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  28.57 
 
 		 901 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  28.57 
 
 		 917 aa  213  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  29.87 
 
 		 1465 aa  210  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06597  alpha-1,2-mannosidase  31.39 
 
 		 534 aa  208  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  27.68 
 
 		 1053 aa  207  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  25 
 
 		 798 aa  207  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  26.64 
 
 		 899 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.5 
 
 		 819 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  26.5 
 
 		 819 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  26.5 
 
 		 819 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  28.63 
 
 		 771 aa  201  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  25.94 
 
 		 823 aa  200  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  26.25 
 
 		 821 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  26.32 
 
 		 1084 aa  199  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  26.16 
 
 		 802 aa  195  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  26.85 
 
 		 890 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.68 
 
 		 846 aa  187  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>