115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06597 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06597  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 
534 aa  1114    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  99.81 
 
 
943 aa  1071    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.37 
 
 
741 aa  269  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  34.48 
 
 
747 aa  266  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  34.27 
 
 
742 aa  259  7e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  33.89 
 
 
753 aa  256  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.79 
 
 
784 aa  253  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  35.27 
 
 
784 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  33.96 
 
 
976 aa  250  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  34.45 
 
 
785 aa  250  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.89 
 
 
807 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  33.84 
 
 
751 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  32.91 
 
 
706 aa  244  3.9999999999999997e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  32.29 
 
 
778 aa  243  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  35.22 
 
 
775 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  33.13 
 
 
759 aa  241  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  33.48 
 
 
754 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  34.38 
 
 
769 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  31.68 
 
 
762 aa  236  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  32.98 
 
 
790 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  32.04 
 
 
761 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  32.64 
 
 
790 aa  229  9e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  32.69 
 
 
773 aa  228  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  32.76 
 
 
747 aa  226  9e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  31.99 
 
 
772 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  34.18 
 
 
777 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.72 
 
 
771 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  31.39 
 
 
728 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  31 
 
 
751 aa  207  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  32.26 
 
 
782 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  30.51 
 
 
774 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  31.59 
 
 
1075 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  30.8 
 
 
758 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  30.08 
 
 
771 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.79 
 
 
753 aa  193  5e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  30.04 
 
 
901 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.58 
 
 
769 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  30.17 
 
 
917 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  30.3 
 
 
755 aa  190  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  31.32 
 
 
806 aa  190  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  32.5 
 
 
826 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  31.11 
 
 
808 aa  189  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  30.24 
 
 
818 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  30.04 
 
 
818 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  32.5 
 
 
826 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  30.33 
 
 
780 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31.08 
 
 
888 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.62 
 
 
886 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  30.62 
 
 
886 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  30.62 
 
 
886 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.85 
 
 
781 aa  186  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  28.9 
 
 
759 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  28.31 
 
 
821 aa  174  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  29.65 
 
 
877 aa  171  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  28.71 
 
 
1089 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  30.17 
 
 
749 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  30.11 
 
 
760 aa  166  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  28.11 
 
 
811 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  28.9 
 
 
1189 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.63 
 
 
1322 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.4 
 
 
827 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  27.49 
 
 
757 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  26.73 
 
 
1114 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  28 
 
 
771 aa  160  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  26.94 
 
 
1084 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  26.84 
 
 
1426 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  30.99 
 
 
764 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  27.14 
 
 
1124 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  26.99 
 
 
757 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  28.35 
 
 
740 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  27.79 
 
 
745 aa  147  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.49 
 
 
912 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1609  alpha-1,2-mannosidase  24.57 
 
 
701 aa  146  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  26.3 
 
 
768 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  27.71 
 
 
716 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  26.8 
 
 
797 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  26.17 
 
 
1427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.01 
 
 
771 aa  138  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  26.43 
 
 
795 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03054  alpha-1,2-mannosidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10520)  25.62 
 
 
821 aa  134  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  26.63 
 
 
1053 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  26 
 
 
899 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  25.98 
 
 
1465 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  25.87 
 
 
961 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  25.79 
 
 
1422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  26.44 
 
 
760 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.48 
 
 
964 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  26.28 
 
 
802 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  25.1 
 
 
819 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  25.1 
 
 
819 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  25.1 
 
 
819 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  24.58 
 
 
823 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03764  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 
730 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  25.68 
 
 
846 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  24.27 
 
 
986 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.07 
 
 
955 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  24.27 
 
 
986 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  25.53 
 
 
890 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.07 
 
 
955 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.27 
 
 
986 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>