116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1774 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  44.58 
 
 
827 aa  639    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 
821 aa  1684    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  44.67 
 
 
1089 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  46.78 
 
 
1075 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  35.17 
 
 
1084 aa  409  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  36.06 
 
 
811 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  34.85 
 
 
877 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  32.4 
 
 
777 aa  350  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  30.43 
 
 
762 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  34.3 
 
 
899 aa  342  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  33.21 
 
 
784 aa  340  8e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  30.17 
 
 
769 aa  340  9e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  30.13 
 
 
742 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.85 
 
 
784 aa  337  5e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  33.58 
 
 
1189 aa  337  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  30.19 
 
 
747 aa  336  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  30.16 
 
 
775 aa  335  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  31.21 
 
 
785 aa  331  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  30.85 
 
 
890 aa  329  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.78 
 
 
807 aa  326  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  29.07 
 
 
759 aa  325  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  28.43 
 
 
749 aa  321  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  29.48 
 
 
747 aa  321  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  27.61 
 
 
753 aa  319  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.53 
 
 
771 aa  319  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  31.59 
 
 
751 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  29.28 
 
 
773 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  27.56 
 
 
761 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  29.16 
 
 
754 aa  313  5.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.29 
 
 
769 aa  313  6.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  27.23 
 
 
976 aa  313  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  29.13 
 
 
760 aa  311  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.74 
 
 
819 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  31.74 
 
 
819 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  31.74 
 
 
819 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  31.09 
 
 
740 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.05 
 
 
741 aa  305  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31.4 
 
 
823 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.4 
 
 
846 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  31.07 
 
 
790 aa  301  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  27.85 
 
 
778 aa  300  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  30.58 
 
 
839 aa  299  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  30.09 
 
 
774 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.84 
 
 
771 aa  296  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  31.46 
 
 
790 aa  295  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  28.97 
 
 
706 aa  291  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  28.48 
 
 
780 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.68 
 
 
849 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  29 
 
 
771 aa  288  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  28.8 
 
 
943 aa  287  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.93 
 
 
955 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  29.93 
 
 
986 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.93 
 
 
955 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.93 
 
 
986 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.93 
 
 
986 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  29.93 
 
 
986 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.93 
 
 
986 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  27.8 
 
 
745 aa  285  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  27.47 
 
 
757 aa  282  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  28.88 
 
 
782 aa  279  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.54 
 
 
964 aa  278  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  28.21 
 
 
758 aa  276  8e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  27.06 
 
 
772 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  28.61 
 
 
961 aa  268  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  26.64 
 
 
759 aa  258  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  32.07 
 
 
1465 aa  257  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  27.33 
 
 
826 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.27 
 
 
886 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  28.27 
 
 
886 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  28.27 
 
 
886 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  26.97 
 
 
826 aa  252  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  27.87 
 
 
755 aa  248  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  27.65 
 
 
888 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  29.95 
 
 
754 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  27.42 
 
 
760 aa  245  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  26.95 
 
 
797 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  27.46 
 
 
795 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  26.03 
 
 
716 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.61 
 
 
900 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  26.61 
 
 
900 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  24.51 
 
 
757 aa  235  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  26.24 
 
 
818 aa  232  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  28.25 
 
 
771 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  26.39 
 
 
818 aa  227  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  27.05 
 
 
806 aa  224  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.84 
 
 
781 aa  224  6e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  27.17 
 
 
808 aa  224  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7541  Alpha-1,2-mannosidase, putative  26.15 
 
 
900 aa  218  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.439325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  25.48 
 
 
768 aa  214  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  26.87 
 
 
751 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.79 
 
 
1322 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  25.98 
 
 
901 aa  205  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  24.57 
 
 
728 aa  204  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  25.56 
 
 
917 aa  203  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  26.16 
 
 
1124 aa  200  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  28.13 
 
 
1426 aa  200  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  26.49 
 
 
1427 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  26.32 
 
 
764 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  23.9 
 
 
798 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  26.46 
 
 
1422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>