142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6161 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  59 
 
 		 1124 aa  1264    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  60.16 
 
 		 1322 aa  1511    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  41.8 
 
 		 1073 aa  788    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  58.86 
 
 		 1427 aa  1607    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  57.92 
 
 		 1422 aa  1594    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  53.22 
 
 		 1114 aa  1107    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  45.96 
 
 		 1053 aa  783    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 1426 aa  2899    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14540  alpha-1,2-mannosidase, putative  38.19 
 
 		 1034 aa  569  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  37.06 
 
 		 780 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  35.67 
 
 		 772 aa  478  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  35.04 
 
 		 774 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  35.16 
 
 		 782 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  34.46 
 
 		 758 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  34.08 
 
 		 759 aa  453  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  34.94 
 
 		 760 aa  423  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.46 
 
 		 781 aa  409  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  34.18 
 
 		 755 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  30.76 
 
 		 771 aa  303  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  29.1 
 
 		 976 aa  297  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  29.84 
 
 		 747 aa  293  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.53 
 
 		 827 aa  288  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1609  alpha-1,2-mannosidase  26.34 
 
 		 701 aa  282  4e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  29.7 
 
 		 754 aa  281  5e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  28.95 
 
 		 759 aa  279  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  28.7 
 
 		 761 aa  278  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  27.74 
 
 		 753 aa  275  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  28.89 
 
 		 742 aa  274  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  30.23 
 
 		 784 aa  272  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  28.75 
 
 		 762 aa  272  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  31.01 
 
 		 1075 aa  271  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  28.37 
 
 		 769 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.68 
 
 		 912 aa  266  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  29.6 
 
 		 751 aa  265  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  33.87 
 
 		 771 aa  265  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  29.64 
 
 		 728 aa  264  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.38 
 
 		 807 aa  263  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  27.55 
 
 		 778 aa  261  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.75 
 
 		 753 aa  258  5e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.51 
 
 		 769 aa  258  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  27.69 
 
 		 785 aa  257  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.05 
 
 		 741 aa  256  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  29.32 
 
 		 777 aa  255  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  29.25 
 
 		 751 aa  254  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  29.08 
 
 		 775 aa  251  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.84 
 
 		 784 aa  251  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  28.5 
 
 		 1089 aa  251  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  28.04 
 
 		 797 aa  247  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.57 
 
 		 771 aa  245  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  28.59 
 
 		 986 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  26.05 
 
 		 749 aa  244  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.46 
 
 		 955 aa  243  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.46 
 
 		 955 aa  243  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.46 
 
 		 986 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.46 
 
 		 986 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.46 
 
 		 986 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  28.33 
 
 		 986 aa  242  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  29.38 
 
 		 1084 aa  241  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  28.35 
 
 		 773 aa  241  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  27.6 
 
 		 747 aa  241  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  25.78 
 
 		 757 aa  240  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  30.69 
 
 		 740 aa  240  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  29.4 
 
 		 790 aa  239  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  26.8 
 
 		 706 aa  238  8e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.98 
 
 		 964 aa  233  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  29.86 
 
 		 811 aa  233  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  26.1 
 
 		 795 aa  232  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  28.39 
 
 		 806 aa  232  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  27.72 
 
 		 1189 aa  231  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.23 
 
 		 846 aa  230  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  28.01 
 
 		 961 aa  229  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  28.68 
 
 		 808 aa  229  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  29.1 
 
 		 790 aa  228  6e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  24.64 
 
 		 716 aa  226  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  26.62 
 
 		 899 aa  224  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  27.7 
 
 		 890 aa  224  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  26.29 
 
 		 943 aa  220  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  25.93 
 
 		 826 aa  219  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  27.34 
 
 		 760 aa  220  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  25.81 
 
 		 826 aa  218  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  27.21 
 
 		 745 aa  213  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  25.14 
 
 		 757 aa  211  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  26.77 
 
 		 818 aa  210  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  27.73 
 
 		 877 aa  209  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.33 
 
 		 849 aa  208  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  26.65 
 
 		 818 aa  208  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  27.16 
 
 		 839 aa  206  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  27.59 
 
 		 768 aa  204  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  25.96 
 
 		 888 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.27 
 
 		 771 aa  201  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  29.17 
 
 		 821 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  27.56 
 
 		 764 aa  198  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  25.42 
 
 		 886 aa  191  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.24 
 
 		 819 aa  190  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  27.24 
 
 		 819 aa  190  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  25.42 
 
 		 886 aa  191  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  25.42 
 
 		 886 aa  191  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  27.24 
 
 		 819 aa  190  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  28.37 
 
 		 1465 aa  189  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  27.02 
 
 		 823 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>