116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2174 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  51.39 
 
 
807 aa  815    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  52.9 
 
 
785 aa  806    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  53.17 
 
 
784 aa  798    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  42.97 
 
 
747 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  47.67 
 
 
778 aa  752    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  63.45 
 
 
777 aa  1002    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 
784 aa  1612    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  49.32 
 
 
762 aa  755    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  50.07 
 
 
775 aa  748    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  43.18 
 
 
761 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  50.54 
 
 
769 aa  734    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  43.92 
 
 
754 aa  638    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  42.52 
 
 
976 aa  629  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  45.25 
 
 
747 aa  626  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  44.2 
 
 
759 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  43.29 
 
 
771 aa  620  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  45.27 
 
 
773 aa  619  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  41.62 
 
 
753 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  44.52 
 
 
742 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  45.78 
 
 
751 aa  598  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  44.8 
 
 
790 aa  580  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  43.92 
 
 
790 aa  570  1e-161  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  42.35 
 
 
769 aa  538  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  40.94 
 
 
706 aa  532  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  40.55 
 
 
741 aa  511  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  35.63 
 
 
806 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  35.82 
 
 
818 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  35.82 
 
 
818 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  36.07 
 
 
826 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  35.63 
 
 
808 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  35.95 
 
 
826 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  37.69 
 
 
827 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  34.63 
 
 
943 aa  435  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  34.9 
 
 
757 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  35.14 
 
 
772 aa  426  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  34.88 
 
 
782 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  34.86 
 
 
888 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  34.54 
 
 
886 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  34.54 
 
 
886 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  34.54 
 
 
886 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  33.04 
 
 
771 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  33.62 
 
 
780 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  32.38 
 
 
901 aa  405  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  32.49 
 
 
917 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  34.33 
 
 
774 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 
759 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  34.46 
 
 
755 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  36.06 
 
 
1089 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  34.44 
 
 
740 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  33.42 
 
 
758 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  32.63 
 
 
760 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  36.06 
 
 
1075 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  35.73 
 
 
877 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  33.42 
 
 
760 aa  371  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.13 
 
 
781 aa  368  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  35.03 
 
 
899 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  32.4 
 
 
749 aa  361  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.22 
 
 
771 aa  355  2e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  33.86 
 
 
961 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  32.05 
 
 
795 aa  347  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  34.97 
 
 
811 aa  346  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.56 
 
 
964 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  34.26 
 
 
986 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  31.86 
 
 
797 aa  343  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.26 
 
 
955 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.26 
 
 
986 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.26 
 
 
986 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.26 
 
 
986 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.99 
 
 
955 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  33.99 
 
 
986 aa  340  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  32.65 
 
 
1084 aa  339  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  33.01 
 
 
821 aa  336  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  34.45 
 
 
1189 aa  336  9e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  31.18 
 
 
745 aa  333  6e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  30.98 
 
 
716 aa  333  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  33.81 
 
 
823 aa  325  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  29.13 
 
 
757 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  31.75 
 
 
890 aa  312  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  32.35 
 
 
764 aa  310  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  33.21 
 
 
771 aa  308  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.55 
 
 
819 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  33.55 
 
 
819 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  33.55 
 
 
819 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  30.28 
 
 
728 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  30.47 
 
 
751 aa  296  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.51 
 
 
753 aa  284  6.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  33.64 
 
 
754 aa  277  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  27.72 
 
 
768 aa  277  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  28.89 
 
 
839 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.48 
 
 
846 aa  274  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.57 
 
 
849 aa  273  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  28.55 
 
 
798 aa  266  8e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  30.23 
 
 
1426 aa  266  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.69 
 
 
912 aa  261  3e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.94 
 
 
1322 aa  253  8.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  28.14 
 
 
1427 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06597  alpha-1,2-mannosidase  35.27 
 
 
534 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  28.76 
 
 
1124 aa  251  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  28.17 
 
 
1114 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  28.07 
 
 
1422 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>