116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4808 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  72.22 
 
 		 774 aa  1155    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  55.3 
 
 		 781 aa  854    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  65.99 
 
 		 772 aa  1054    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  65.11 
 
 		 782 aa  1044    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  64.11 
 
 		 759 aa  1048    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 758 aa  1584    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  68.91 
 
 		 780 aa  1138    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  46.97 
 
 		 755 aa  700    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  68.02 
 
 		 760 aa  1026    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  34.46 
 
 		 1426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  34.57 
 
 		 1322 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  35.2 
 
 		 1427 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  34.11 
 
 		 1114 aa  450  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  34.58 
 
 		 771 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  34.99 
 
 		 1124 aa  442  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  34.78 
 
 		 1422 aa  439  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  34.15 
 
 		 778 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  34.54 
 
 		 976 aa  421  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  34.69 
 
 		 769 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  35.11 
 
 		 759 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  34.9 
 
 		 747 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  34.6 
 
 		 762 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  33.58 
 
 		 785 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  34.4 
 
 		 753 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.33 
 
 		 784 aa  398  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  32.38 
 
 		 797 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  33.72 
 
 		 775 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  33.91 
 
 		 761 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  35.05 
 
 		 754 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.59 
 
 		 807 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  33.42 
 
 		 784 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  34.44 
 
 		 706 aa  383  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.9 
 
 		 771 aa  382  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.58 
 
 		 827 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  32.99 
 
 		 1053 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  33.7 
 
 		 742 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  32.19 
 
 		 747 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  33.42 
 
 		 777 aa  364  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  33.38 
 
 		 751 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.35 
 
 		 1073 aa  361  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  31.33 
 
 		 773 aa  351  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  31.38 
 
 		 795 aa  342  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  30.83 
 
 		 757 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  31.95 
 
 		 1089 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  31.57 
 
 		 790 aa  332  1e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  31.56 
 
 		 1075 aa  331  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1609  alpha-1,2-mannosidase  29.32 
 
 		 701 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.95 
 
 		 741 aa  324  3e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  32.15 
 
 		 751 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  31.44 
 
 		 790 aa  323  7e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  31.86 
 
 		 728 aa  319  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  29.43 
 
 		 771 aa  308  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.89 
 
 		 769 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  28.72 
 
 		 1189 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  30.38 
 
 		 877 aa  299  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  30.63 
 
 		 745 aa  296  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  30.33 
 
 		 740 aa  294  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  29.8 
 
 		 768 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.01 
 
 		 912 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  28.33 
 
 		 1084 aa  290  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  30.43 
 
 		 764 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  29.08 
 
 		 943 aa  284  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  29.41 
 
 		 899 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  28.33 
 
 		 961 aa  279  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  28.33 
 
 		 749 aa  278  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.48 
 
 		 955 aa  277  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  28.55 
 
 		 760 aa  277  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.48 
 
 		 986 aa  276  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.48 
 
 		 986 aa  276  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.48 
 
 		 986 aa  276  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.48 
 
 		 955 aa  276  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  28.48 
 
 		 986 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  28.35 
 
 		 986 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  28.7 
 
 		 811 aa  275  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.28 
 
 		 964 aa  273  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  27.98 
 
 		 821 aa  272  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.84 
 
 		 753 aa  271  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14540  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.2 
 
 		 1034 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  28.98 
 
 		 818 aa  261  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  28.43 
 
 		 888 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  28.43 
 
 		 716 aa  258  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  29 
 
 		 886 aa  257  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  29 
 
 		 886 aa  257  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  29 
 
 		 886 aa  257  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  28.86 
 
 		 818 aa  257  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  29.08 
 
 		 826 aa  257  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  29.05 
 
 		 901 aa  257  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  28.41 
 
 		 757 aa  256  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  28.84 
 
 		 826 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.35 
 
 		 846 aa  245  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  27.31 
 
 		 890 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.14 
 
 		 771 aa  242  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  29.16 
 
 		 806 aa  242  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.15 
 
 		 849 aa  241  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  29.04 
 
 		 808 aa  241  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  26.59 
 
 		 839 aa  235  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.47 
 
 		 819 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  27.47 
 
 		 819 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  27.47 
 
 		 819 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  27.46 
 
 		 823 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>