116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4820 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 
757 aa  1580    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  37.37 
 
 
807 aa  463  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  37.2 
 
 
762 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  35.71 
 
 
785 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  37.28 
 
 
769 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  36.35 
 
 
761 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.97 
 
 
784 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  36.35 
 
 
775 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  36.42 
 
 
759 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  35.44 
 
 
778 aa  438  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  35.35 
 
 
784 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  34.59 
 
 
976 aa  426  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  35.68 
 
 
771 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  35.03 
 
 
753 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  33.9 
 
 
747 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  34.87 
 
 
747 aa  416  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  35.01 
 
 
777 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  33.46 
 
 
771 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.99 
 
 
827 aa  399  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  34.55 
 
 
742 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  34.37 
 
 
790 aa  395  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 
754 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  34.33 
 
 
706 aa  389  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  33.91 
 
 
751 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  33.94 
 
 
749 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  34.24 
 
 
790 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  33.09 
 
 
1075 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  32.38 
 
 
773 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  34 
 
 
797 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  33.17 
 
 
1089 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  32.99 
 
 
740 aa  365  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  34.35 
 
 
769 aa  363  5.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  31.45 
 
 
780 aa  360  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  31.45 
 
 
760 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  32.3 
 
 
795 aa  354  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  32.48 
 
 
745 aa  353  8e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  31.12 
 
 
782 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  31.14 
 
 
758 aa  343  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.69 
 
 
741 aa  342  1e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  30.72 
 
 
774 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  30.62 
 
 
818 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  32.35 
 
 
877 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  30.62 
 
 
818 aa  337  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  31.82 
 
 
755 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  32.69 
 
 
961 aa  332  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.65 
 
 
955 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  30.73 
 
 
728 aa  324  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.68 
 
 
888 aa  324  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  31.39 
 
 
986 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  31.52 
 
 
986 aa  323  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.39 
 
 
955 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.39 
 
 
986 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.39 
 
 
986 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.39 
 
 
986 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  28.92 
 
 
759 aa  320  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.4 
 
 
886 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  29.4 
 
 
886 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  29.4 
 
 
886 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  30.04 
 
 
772 aa  317  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.69 
 
 
964 aa  317  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  30.67 
 
 
826 aa  314  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  30.75 
 
 
1189 aa  313  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  30.91 
 
 
826 aa  313  9e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.75 
 
 
771 aa  310  5e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  29.37 
 
 
808 aa  310  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  29.49 
 
 
806 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  29.16 
 
 
1084 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  29.66 
 
 
811 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31.3 
 
 
823 aa  301  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  31.14 
 
 
899 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.51 
 
 
819 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  31.51 
 
 
819 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  31.51 
 
 
819 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  29.07 
 
 
901 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.82 
 
 
781 aa  293  1e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  31.06 
 
 
751 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  29.47 
 
 
890 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  28.76 
 
 
760 aa  287  5e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  29.59 
 
 
764 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  28.9 
 
 
768 aa  284  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  28.45 
 
 
757 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  27.83 
 
 
943 aa  276  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  27.1 
 
 
821 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.05 
 
 
846 aa  275  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.89 
 
 
753 aa  271  5e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  28.83 
 
 
716 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  27.19 
 
 
839 aa  261  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.4 
 
 
849 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  33.27 
 
 
1465 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  26.43 
 
 
802 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  25.98 
 
 
1124 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  25.78 
 
 
1426 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  28.57 
 
 
754 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0965  alpha-1,2-mannosidase  27.34 
 
 
680 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  25.46 
 
 
1322 aa  226  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  26.05 
 
 
1427 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  25.27 
 
 
1114 aa  218  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  25.83 
 
 
912 aa  214  5.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  25.72 
 
 
1422 aa  214  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  30.18 
 
 
901 aa  213  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>