116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2650 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  100 
 
 		 846 aa  1757    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  63.09 
 
 		 839 aa  1099    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  62.84 
 
 		 849 aa  1098    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  46.75 
 
 		 1084 aa  746    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  40.6 
 
 		 811 aa  622  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.07 
 
 		 955 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.2 
 
 		 955 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.04 
 
 		 986 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.04 
 
 		 986 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  35.04 
 
 		 986 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  35.04 
 
 		 986 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.04 
 
 		 986 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.88 
 
 		 964 aa  415  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  34.9 
 
 		 1189 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  33.75 
 
 		 961 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.25 
 
 		 827 aa  399  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  31.6 
 
 		 1089 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  33.25 
 
 		 899 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  33.25 
 
 		 877 aa  373  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  34.81 
 
 		 890 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.53 
 
 		 819 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  33.53 
 
 		 819 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  33.53 
 
 		 819 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  33.25 
 
 		 823 aa  354  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  31.59 
 
 		 1075 aa  336  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.61 
 
 		 784 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  29.61 
 
 		 785 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  31.64 
 
 		 749 aa  310  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  29.64 
 
 		 771 aa  310  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.52 
 
 		 807 aa  310  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  31.08 
 
 		 742 aa  307  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  29.95 
 
 		 745 aa  305  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  35.06 
 
 		 1465 aa  303  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  28.4 
 
 		 821 aa  303  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  29.64 
 
 		 747 aa  294  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  30.77 
 
 		 759 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  29.78 
 
 		 775 aa  292  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  29.89 
 
 		 760 aa  290  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  29.86 
 
 		 740 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  27.88 
 
 		 778 aa  283  7.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  28.99 
 
 		 747 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  29.04 
 
 		 753 aa  282  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  27.4 
 
 		 976 aa  282  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  28.89 
 
 		 777 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  28.48 
 
 		 784 aa  275  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  28.62 
 
 		 762 aa  273  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  28.17 
 
 		 790 aa  273  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  28.32 
 
 		 761 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  27.94 
 
 		 772 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  27.68 
 
 		 790 aa  271  4e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  28.14 
 
 		 757 aa  271  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.95 
 
 		 741 aa  266  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.64 
 
 		 771 aa  265  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  28.91 
 
 		 754 aa  265  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  26.35 
 
 		 782 aa  265  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  27.68 
 
 		 754 aa  264  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  28.61 
 
 		 769 aa  263  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  28.31 
 
 		 774 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.01 
 
 		 769 aa  260  6e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.06 
 
 		 900 aa  258  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  28.06 
 
 		 900 aa  258  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.05 
 
 		 771 aa  256  9e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  27.79 
 
 		 759 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  28.75 
 
 		 773 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  27.86 
 
 		 751 aa  249  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7541  Alpha-1,2-mannosidase, putative  28.55 
 
 		 900 aa  248  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.439325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  27.35 
 
 		 758 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  25.4 
 
 		 780 aa  240  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  27.51 
 
 		 706 aa  239  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  27.09 
 
 		 826 aa  238  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  26.86 
 
 		 826 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.93 
 
 		 781 aa  233  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  27.62 
 
 		 716 aa  230  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  28.23 
 
 		 1426 aa  225  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.07 
 
 		 1322 aa  223  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  26.32 
 
 		 943 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.73 
 
 		 886 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  26.73 
 
 		 886 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  26.73 
 
 		 886 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  28.5 
 
 		 755 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  26.24 
 
 		 888 aa  217  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  26.33 
 
 		 760 aa  216  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  26.72 
 
 		 1124 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  26.53 
 
 		 806 aa  211  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  26.67 
 
 		 1114 aa  211  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  26.49 
 
 		 808 aa  211  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  26.15 
 
 		 1427 aa  210  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  26.24 
 
 		 795 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  26.3 
 
 		 1422 aa  204  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  25.29 
 
 		 818 aa  198  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  25.4 
 
 		 917 aa  194  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  25.64 
 
 		 797 aa  193  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  25.29 
 
 		 818 aa  192  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  25.49 
 
 		 764 aa  188  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  26.68 
 
 		 728 aa  187  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  24.85 
 
 		 771 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  25.47 
 
 		 912 aa  184  6e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.67 
 
 		 753 aa  184  7e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  23.44 
 
 		 757 aa  177  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  23.89 
 
 		 802 aa  173  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>