117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06599 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  99.45 
 
 
901 aa  1867    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  100 
 
 
917 aa  1911    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  41.66 
 
 
826 aa  655    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  41.87 
 
 
826 aa  658    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  39.76 
 
 
818 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  39.69 
 
 
818 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  36.65 
 
 
806 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  36.53 
 
 
808 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  32.68 
 
 
747 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.86 
 
 
807 aa  405  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  32.38 
 
 
784 aa  399  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  31.82 
 
 
777 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  32.57 
 
 
775 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  30.96 
 
 
976 aa  389  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  30.3 
 
 
761 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  31.11 
 
 
769 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.61 
 
 
771 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  31.21 
 
 
785 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  31.66 
 
 
751 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  31.32 
 
 
762 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  30.84 
 
 
778 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  31.61 
 
 
754 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  31.54 
 
 
773 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.93 
 
 
784 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  30.68 
 
 
742 aa  364  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  30.66 
 
 
747 aa  357  5.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  30.24 
 
 
753 aa  353  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  29.9 
 
 
706 aa  350  5e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  30.22 
 
 
790 aa  350  9e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  30.22 
 
 
790 aa  349  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  28.96 
 
 
759 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.3 
 
 
769 aa  345  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  28.96 
 
 
943 aa  331  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.98 
 
 
741 aa  328  3e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.2 
 
 
827 aa  291  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.48 
 
 
886 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  27.48 
 
 
886 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  27.48 
 
 
886 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  26.85 
 
 
888 aa  263  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  27.11 
 
 
1084 aa  256  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  28.54 
 
 
1089 aa  253  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  26.14 
 
 
760 aa  250  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  26.59 
 
 
745 aa  242  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  26.61 
 
 
740 aa  240  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  25.76 
 
 
771 aa  235  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  27.38 
 
 
774 aa  233  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  25.37 
 
 
771 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  26.35 
 
 
1189 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  27.27 
 
 
751 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  26.15 
 
 
757 aa  220  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  26.47 
 
 
780 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  29.35 
 
 
755 aa  213  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  28.57 
 
 
728 aa  213  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  24.89 
 
 
782 aa  211  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  29.47 
 
 
757 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  25.64 
 
 
821 aa  198  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  25.4 
 
 
846 aa  194  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  23.72 
 
 
819 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  23.72 
 
 
819 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  23.72 
 
 
819 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  24.72 
 
 
716 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06597  alpha-1,2-mannosidase  30.17 
 
 
534 aa  191  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.57 
 
 
753 aa  188  5e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  27.27 
 
 
760 aa  187  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  28.12 
 
 
749 aa  175  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  25.11 
 
 
768 aa  172  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  30.63 
 
 
1075 aa  170  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  36.82 
 
 
772 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  22.82 
 
 
797 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06593  alpha-1,2-mannosidase  29.37 
 
 
436 aa  159  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  22.99 
 
 
802 aa  157  7e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  30.48 
 
 
877 aa  156  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1609  alpha-1,2-mannosidase  25 
 
 
701 aa  156  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  38.77 
 
 
759 aa  155  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  26.4 
 
 
890 aa  155  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  24.56 
 
 
1124 aa  151  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  25.46 
 
 
1427 aa  150  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.75 
 
 
781 aa  149  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  25.19 
 
 
1422 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  36.29 
 
 
758 aa  147  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  29.25 
 
 
986 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  29.25 
 
 
986 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.25 
 
 
955 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.25 
 
 
955 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.25 
 
 
986 aa  146  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.25 
 
 
986 aa  146  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.25 
 
 
986 aa  146  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  23.78 
 
 
1114 aa  146  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  22.69 
 
 
798 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.05 
 
 
964 aa  144  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  36.32 
 
 
1426 aa  144  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  27.23 
 
 
899 aa  142  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  26.99 
 
 
961 aa  141  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  28.72 
 
 
1465 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  24.88 
 
 
764 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  32.76 
 
 
1053 aa  131  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.13 
 
 
1322 aa  130  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  27.79 
 
 
811 aa  124  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  24.52 
 
 
839 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  23.64 
 
 
849 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>