116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3507 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  41.1 
 
 		 846 aa  636    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  42.59 
 
 		 839 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  43.97 
 
 		 849 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  51.39 
 
 		 1084 aa  760    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 811 aa  1637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  40.12 
 
 		 827 aa  481  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  39.07 
 
 		 1189 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  37.95 
 
 		 1089 aa  448  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  39.53 
 
 		 1075 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  38.45 
 
 		 877 aa  431  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  37.92 
 
 		 899 aa  416  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.07 
 
 		 955 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.07 
 
 		 955 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.07 
 
 		 986 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.07 
 
 		 986 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  35.07 
 
 		 986 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  35.07 
 
 		 986 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.07 
 
 		 986 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.8 
 
 		 964 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  35.49 
 
 		 821 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  33.64 
 
 		 961 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  34.23 
 
 		 890 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  32.42 
 
 		 785 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  34.59 
 
 		 784 aa  359  9e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.78 
 
 		 784 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.62 
 
 		 807 aa  350  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  31.45 
 
 		 759 aa  347  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  29.88 
 
 		 976 aa  339  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  30.37 
 
 		 747 aa  338  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  32.11 
 
 		 823 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  31.85 
 
 		 775 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.19 
 
 		 771 aa  337  7e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  32.22 
 
 		 777 aa  333  9e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  29.57 
 
 		 749 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  29.83 
 
 		 754 aa  331  3e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  31.75 
 
 		 771 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  33 
 
 		 790 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  30.45 
 
 		 780 aa  326  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  30.45 
 
 		 762 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.35 
 
 		 819 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  31.35 
 
 		 819 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  31.35 
 
 		 819 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  28.78 
 
 		 778 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  30.14 
 
 		 745 aa  321  3.9999999999999996e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  31.1 
 
 		 773 aa  319  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  27.9 
 
 		 753 aa  318  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.85 
 
 		 769 aa  317  5e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  29.54 
 
 		 757 aa  317  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  32.25 
 
 		 790 aa  316  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  32.47 
 
 		 740 aa  312  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  28.62 
 
 		 761 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  30.16 
 
 		 747 aa  312  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  29.93 
 
 		 769 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  30.47 
 
 		 772 aa  310  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  29.16 
 
 		 755 aa  310  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.99 
 
 		 771 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  36.28 
 
 		 1465 aa  307  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.55 
 
 		 741 aa  306  1.0000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  34.51 
 
 		 754 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  30.27 
 
 		 782 aa  301  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  30.26 
 
 		 774 aa  300  8e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  29.9 
 
 		 742 aa  293  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  29.12 
 
 		 706 aa  293  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  30.72 
 
 		 760 aa  290  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  33.13 
 
 		 771 aa  289  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  28.7 
 
 		 758 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  28.04 
 
 		 759 aa  287  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  29.72 
 
 		 797 aa  283  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  29.37 
 
 		 826 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  28.32 
 
 		 943 aa  276  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  29.17 
 
 		 826 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  31.12 
 
 		 1114 aa  275  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.05 
 
 		 900 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  30.05 
 
 		 900 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  29.38 
 
 		 751 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.41 
 
 		 888 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.28 
 
 		 886 aa  271  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  29.28 
 
 		 886 aa  271  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  29.28 
 
 		 886 aa  271  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.34 
 
 		 781 aa  269  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  28.98 
 
 		 808 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  27.74 
 
 		 818 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  28.98 
 
 		 806 aa  263  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  27.51 
 
 		 818 aa  262  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  27.17 
 
 		 795 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  29.77 
 
 		 751 aa  252  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  27.01 
 
 		 716 aa  252  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  27.91 
 
 		 728 aa  250  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  28.01 
 
 		 760 aa  250  8e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7541  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.33 
 
 		 900 aa  250  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.439325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.97 
 
 		 1322 aa  249  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.17 
 
 		 753 aa  239  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  27.63 
 
 		 1427 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  29.86 
 
 		 1426 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  25.06 
 
 		 757 aa  232  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  27.48 
 
 		 798 aa  231  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  27.71 
 
 		 1422 aa  230  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  26.99 
 
 		 901 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  25.86 
 
 		 768 aa  228  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.64 
 
 		 912 aa  225  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>