116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06598 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  99.01 
 
 
806 aa  1660    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  48.22 
 
 
818 aa  751    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 
808 aa  1680    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  48.1 
 
 
818 aa  748    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  42.53 
 
 
826 aa  588  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  42.3 
 
 
826 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  36.63 
 
 
901 aa  527  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  36.53 
 
 
917 aa  525  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  36.91 
 
 
747 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  38.16 
 
 
751 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  36.52 
 
 
742 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  36.18 
 
 
784 aa  452  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  35.83 
 
 
747 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  34.65 
 
 
762 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  36.79 
 
 
777 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  35.88 
 
 
775 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  35.77 
 
 
976 aa  428  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 
778 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  34.78 
 
 
771 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  34.77 
 
 
769 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.12 
 
 
784 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.22 
 
 
807 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  34.6 
 
 
773 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  33.67 
 
 
785 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  35.53 
 
 
790 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  33.85 
 
 
761 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  35.41 
 
 
790 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  33.89 
 
 
754 aa  399  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  32.56 
 
 
759 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  34.47 
 
 
706 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.01 
 
 
741 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  34.27 
 
 
753 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  34.47 
 
 
769 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  30.26 
 
 
943 aa  343  9e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31.61 
 
 
888 aa  331  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.15 
 
 
886 aa  330  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  31.15 
 
 
886 aa  330  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  31.15 
 
 
886 aa  330  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  30.43 
 
 
749 aa  316  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.11 
 
 
827 aa  313  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  29.13 
 
 
757 aa  301  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  31.43 
 
 
760 aa  297  5e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  29.72 
 
 
740 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  30.78 
 
 
1075 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  29.49 
 
 
745 aa  275  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.18 
 
 
771 aa  274  4.0000000000000004e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  30.91 
 
 
1089 aa  273  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  28.76 
 
 
716 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  29.08 
 
 
1084 aa  271  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.18 
 
 
961 aa  265  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.96 
 
 
781 aa  262  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.81 
 
 
955 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  28.94 
 
 
986 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.81 
 
 
955 aa  261  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  28.5 
 
 
986 aa  261  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.81 
 
 
986 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.81 
 
 
986 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.81 
 
 
986 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  29.98 
 
 
1189 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  27.38 
 
 
782 aa  258  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  28.91 
 
 
780 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  29.04 
 
 
774 aa  257  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.59 
 
 
964 aa  254  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  27.46 
 
 
772 aa  254  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  29.1 
 
 
811 aa  252  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  26.78 
 
 
771 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  28.61 
 
 
755 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  25.84 
 
 
757 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  29.04 
 
 
758 aa  240  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  28.98 
 
 
899 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  27.88 
 
 
764 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  26.06 
 
 
760 aa  233  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.63 
 
 
849 aa  230  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  27.09 
 
 
728 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  27.3 
 
 
759 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.62 
 
 
846 aa  223  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  27.49 
 
 
751 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.27 
 
 
819 aa  222  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  27.27 
 
 
819 aa  222  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  26.99 
 
 
768 aa  221  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  27.27 
 
 
819 aa  222  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  27.05 
 
 
823 aa  220  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  28.68 
 
 
1426 aa  219  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  26.03 
 
 
771 aa  217  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  26.79 
 
 
839 aa  217  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  26.73 
 
 
797 aa  216  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  28.57 
 
 
877 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  27.86 
 
 
821 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.63 
 
 
753 aa  208  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  26.17 
 
 
890 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  27.86 
 
 
802 aa  207  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  25.81 
 
 
795 aa  203  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  26.65 
 
 
901 aa  200  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  27.19 
 
 
798 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  26.56 
 
 
1124 aa  190  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06597  alpha-1,2-mannosidase  31.11 
 
 
534 aa  189  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  26.35 
 
 
1427 aa  189  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  24.46 
 
 
1114 aa  181  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  25.82 
 
 
1422 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0965  alpha-1,2-mannosidase  24.62 
 
 
680 aa  178  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.703559 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>