116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3976 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  45.87 
 
 		 771 aa  681    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  46.98 
 
 		 747 aa  687    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  52.8 
 
 		 753 aa  843    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  43.18 
 
 		 784 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  59.75 
 
 		 759 aa  933    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 761 aa  1578    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  43.34 
 
 		 754 aa  639    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  43.95 
 
 		 747 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  41.33 
 
 		 773 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  42.68 
 
 		 778 aa  608  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  42.6 
 
 		 777 aa  610  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  43.36 
 
 		 762 aa  611  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  42.05 
 
 		 785 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  42.04 
 
 		 751 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  43.2 
 
 		 976 aa  606  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  41.8 
 
 		 769 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  42.22 
 
 		 807 aa  597  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  42.88 
 
 		 775 aa  597  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  41.45 
 
 		 784 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  41.25 
 
 		 790 aa  592  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  41.52 
 
 		 790 aa  591  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  41.08 
 
 		 742 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  41.42 
 
 		 769 aa  560  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  41.35 
 
 		 706 aa  552  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  37.47 
 
 		 741 aa  498  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  37.02 
 
 		 826 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  37.27 
 
 		 826 aa  481  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  36.28 
 
 		 827 aa  452  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  36.09 
 
 		 757 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  33.74 
 
 		 818 aa  435  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  33.25 
 
 		 818 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  33.42 
 
 		 888 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.66 
 
 		 886 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  33.66 
 
 		 886 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  33.66 
 
 		 886 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  34.2 
 
 		 780 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  33.02 
 
 		 943 aa  416  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  33.72 
 
 		 806 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  33.85 
 
 		 808 aa  405  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  34.49 
 
 		 774 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  33.91 
 
 		 758 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  30.52 
 
 		 901 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  33.6 
 
 		 749 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  32.95 
 
 		 782 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  30.3 
 
 		 917 aa  385  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  32.87 
 
 		 760 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  32.99 
 
 		 772 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  32.04 
 
 		 771 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  32.86 
 
 		 1075 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  32.61 
 
 		 760 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  32.64 
 
 		 1089 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  32.4 
 
 		 740 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  32.85 
 
 		 795 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  32.53 
 
 		 797 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  34.26 
 
 		 745 aa  365  2e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  32.01 
 
 		 759 aa  363  7.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.81 
 
 		 781 aa  362  2e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  31.08 
 
 		 755 aa  361  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.8 
 
 		 771 aa  351  3e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  32.49 
 
 		 728 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  30.59 
 
 		 1189 aa  332  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  31.12 
 
 		 877 aa  330  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  31.49 
 
 		 768 aa  323  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  29.42 
 
 		 764 aa  323  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  30.8 
 
 		 899 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  30.62 
 
 		 757 aa  318  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  29.74 
 
 		 1084 aa  316  8e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  27.56 
 
 		 821 aa  312  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.41 
 
 		 964 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  33.4 
 
 		 751 aa  303  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  29.69 
 
 		 986 aa  303  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.8 
 
 		 961 aa  303  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.55 
 
 		 986 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.55 
 
 		 986 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.55 
 
 		 986 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.55 
 
 		 955 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.55 
 
 		 955 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  29.55 
 
 		 986 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  28.71 
 
 		 716 aa  300  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.87 
 
 		 753 aa  300  8e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  29.68 
 
 		 839 aa  296  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  28.9 
 
 		 811 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.71 
 
 		 849 aa  294  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.77 
 
 		 823 aa  289  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  28.13 
 
 		 771 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.03 
 
 		 819 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  30.03 
 
 		 819 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  30.03 
 
 		 819 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  28.52 
 
 		 1114 aa  278  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.32 
 
 		 846 aa  272  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  28.7 
 
 		 1426 aa  271  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  28.59 
 
 		 890 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  28.86 
 
 		 901 aa  264  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.06 
 
 		 912 aa  259  9e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03054  alpha-1,2-mannosidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10520)  26.88 
 
 		 821 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  27.26 
 
 		 802 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.87 
 
 		 1322 aa  254  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  27.96 
 
 		 1124 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  27.85 
 
 		 1427 aa  250  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  26.19 
 
 		 798 aa  246  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>