116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2651 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  100 
 
 
807 aa  1687    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  43.35 
 
 
771 aa  654    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  69.73 
 
 
785 aa  1150    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  70.29 
 
 
784 aa  1163    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  49.07 
 
 
778 aa  746    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  46.85 
 
 
762 aa  741    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  48.03 
 
 
777 aa  758    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  52.78 
 
 
784 aa  814    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  49.13 
 
 
775 aa  740    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  49.41 
 
 
769 aa  739    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  44.58 
 
 
747 aa  631  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  43.83 
 
 
976 aa  629  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  43.04 
 
 
759 aa  626  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  44.21 
 
 
747 aa  617  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  41.5 
 
 
742 aa  600  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  42.22 
 
 
761 aa  597  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  40.79 
 
 
753 aa  591  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  41.04 
 
 
790 aa  587  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  41.04 
 
 
790 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  41.81 
 
 
754 aa  574  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  42.95 
 
 
773 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  41.29 
 
 
751 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  39.16 
 
 
769 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  39.82 
 
 
706 aa  519  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  37.61 
 
 
741 aa  499  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  38.7 
 
 
818 aa  490  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  38.4 
 
 
818 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  37.11 
 
 
757 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  34.77 
 
 
826 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  34.65 
 
 
826 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.62 
 
 
827 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  33.41 
 
 
943 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  34.72 
 
 
772 aa  429  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  32.59 
 
 
888 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  34.55 
 
 
740 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  34.6 
 
 
806 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  33.8 
 
 
760 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  33.91 
 
 
782 aa  416  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  34.22 
 
 
808 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  33.03 
 
 
771 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  32.86 
 
 
901 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.83 
 
 
886 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  31.83 
 
 
886 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  31.83 
 
 
886 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  32.86 
 
 
917 aa  405  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  33.83 
 
 
1075 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  32.73 
 
 
780 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  33.25 
 
 
759 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  33.17 
 
 
1089 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  33.42 
 
 
760 aa  396  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  34.22 
 
 
749 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  32.99 
 
 
774 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  32.59 
 
 
758 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  34.38 
 
 
899 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  30.53 
 
 
1084 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  32.13 
 
 
755 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  32.46 
 
 
716 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  32.32 
 
 
961 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  33.12 
 
 
745 aa  363  8e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  31.81 
 
 
986 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  33.38 
 
 
797 aa  361  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  31.63 
 
 
877 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.81 
 
 
955 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.81 
 
 
955 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.81 
 
 
986 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.81 
 
 
986 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  31.81 
 
 
986 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.81 
 
 
986 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.3 
 
 
964 aa  357  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.71 
 
 
781 aa  357  6.999999999999999e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  31.82 
 
 
1189 aa  356  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.2 
 
 
771 aa  350  4e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  32.49 
 
 
795 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  31.22 
 
 
811 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  30.66 
 
 
757 aa  337  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  32.6 
 
 
771 aa  330  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  36.74 
 
 
751 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  37.5 
 
 
728 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  31.33 
 
 
764 aa  328  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  30.36 
 
 
890 aa  325  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.95 
 
 
823 aa  320  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  28.78 
 
 
821 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.26 
 
 
819 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  30.26 
 
 
819 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  30.26 
 
 
819 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.52 
 
 
846 aa  310  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  27.82 
 
 
839 aa  287  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.27 
 
 
849 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  29.06 
 
 
768 aa  284  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  27.76 
 
 
798 aa  276  8e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.03 
 
 
753 aa  275  3e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.97 
 
 
1322 aa  271  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.6 
 
 
900 aa  268  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  27.6 
 
 
900 aa  268  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  29.06 
 
 
754 aa  264  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  32.17 
 
 
1465 aa  263  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.46 
 
 
912 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  27.5 
 
 
1426 aa  255  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  26.88 
 
 
901 aa  253  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  27.59 
 
 
802 aa  252  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>