116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0120 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  53.31 
 
 		 781 aa  804    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 772 aa  1611    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  62.02 
 
 		 774 aa  991    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  73.83 
 
 		 782 aa  1232    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  59.65 
 
 		 759 aa  948    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  65.99 
 
 		 758 aa  1054    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  61.47 
 
 		 780 aa  1013    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  45.78 
 
 		 755 aa  690    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  64.33 
 
 		 760 aa  1040    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  35.67 
 
 		 1426 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  35.41 
 
 		 1322 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  36.28 
 
 		 1114 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  35.92 
 
 		 1427 aa  458  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  36.07 
 
 		 1422 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  33.62 
 
 		 771 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  35.03 
 
 		 1124 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  36.22 
 
 		 759 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.72 
 
 		 807 aa  429  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  36.21 
 
 		 784 aa  420  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  33.42 
 
 		 778 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  33.88 
 
 		 754 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  34.12 
 
 		 976 aa  416  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  33.98 
 
 		 747 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  33.46 
 
 		 785 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  33.68 
 
 		 753 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  34.92 
 
 		 742 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  33.04 
 
 		 747 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.5 
 
 		 784 aa  395  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  34.61 
 
 		 706 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.84 
 
 		 771 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  34.95 
 
 		 751 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  34.62 
 
 		 777 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  33.16 
 
 		 773 aa  389  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 		 1053 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  32.42 
 
 		 769 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  32.99 
 
 		 761 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  33.55 
 
 		 775 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  32.9 
 
 		 762 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  32.11 
 
 		 797 aa  366  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.5 
 
 		 827 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  32.79 
 
 		 795 aa  357  5.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  32.7 
 
 		 1089 aa  350  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1609  alpha-1,2-mannosidase  30.52 
 
 		 701 aa  350  5e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.55 
 
 		 1073 aa  350  6e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  31.55 
 
 		 771 aa  348  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  31.88 
 
 		 790 aa  341  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  32.9 
 
 		 740 aa  333  6e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  30.96 
 
 		 790 aa  332  1e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.64 
 
 		 741 aa  327  5e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  31.71 
 
 		 728 aa  323  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  29.59 
 
 		 760 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  30.14 
 
 		 745 aa  316  9e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  30.04 
 
 		 757 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  31.1 
 
 		 1075 aa  314  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  28.67 
 
 		 749 aa  313  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  29.23 
 
 		 943 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  31.48 
 
 		 751 aa  307  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  28.75 
 
 		 1189 aa  304  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  29.01 
 
 		 1084 aa  299  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  30.51 
 
 		 764 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.35 
 
 		 769 aa  294  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.41 
 
 		 771 aa  293  6e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  30.81 
 
 		 811 aa  292  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14540  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.43 
 
 		 1034 aa  291  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254996  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.6 
 
 		 912 aa  287  7e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  28.95 
 
 		 768 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  29.98 
 
 		 826 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  28.85 
 
 		 877 aa  283  9e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  29.5 
 
 		 826 aa  281  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  28.49 
 
 		 818 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  29.52 
 
 		 899 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  28.49 
 
 		 818 aa  278  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.19 
 
 		 753 aa  276  1.0000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.94 
 
 		 846 aa  271  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  28.49 
 
 		 716 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  26.7 
 
 		 821 aa  269  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  28.24 
 
 		 757 aa  268  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  27.54 
 
 		 961 aa  263  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.91 
 
 		 986 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.91 
 
 		 986 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.91 
 
 		 986 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  27.78 
 
 		 986 aa  258  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  27.91 
 
 		 986 aa  257  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.91 
 
 		 955 aa  257  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.78 
 
 		 955 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  28.78 
 
 		 888 aa  256  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  27.58 
 
 		 806 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  27.46 
 
 		 808 aa  252  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.03 
 
 		 964 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.86 
 
 		 886 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  28.86 
 
 		 886 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  28.86 
 
 		 886 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.88 
 
 		 849 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  27.8 
 
 		 901 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  25.61 
 
 		 839 aa  240  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  26.42 
 
 		 890 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  25.86 
 
 		 901 aa  233  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06597  alpha-1,2-mannosidase  31.99 
 
 		 534 aa  225  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  25.76 
 
 		 802 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.35 
 
 		 819 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>