116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14540 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14540  alpha-1,2-mannosidase, putative  100 
 
 		 1034 aa  2048    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  38.92 
 
 		 1114 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  38.2 
 
 		 1124 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  38.19 
 
 		 1426 aa  571  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  37.72 
 
 		 1427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  37.98 
 
 		 1422 aa  561  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  38.23 
 
 		 1322 aa  540  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  40.89 
 
 		 1053 aa  542  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  39.36 
 
 		 1073 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  29.7 
 
 		 772 aa  300  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  28.61 
 
 		 759 aa  298  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  28.53 
 
 		 780 aa  291  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  28.88 
 
 		 774 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.66 
 
 		 781 aa  282  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  29.85 
 
 		 760 aa  280  9e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  28.39 
 
 		 782 aa  279  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  27.33 
 
 		 758 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  28.08 
 
 		 755 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1609  alpha-1,2-mannosidase  25.85 
 
 		 701 aa  242  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  25.12 
 
 		 754 aa  170  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  28.78 
 
 		 839 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.11 
 
 		 741 aa  168  5e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  24.23 
 
 		 747 aa  167  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  26.37 
 
 		 751 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  27.21 
 
 		 784 aa  164  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  24.87 
 
 		 759 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  25.85 
 
 		 742 aa  158  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.44 
 
 		 849 aa  156  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  25.88 
 
 		 807 aa  154  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.01 
 
 		 827 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  23.33 
 
 		 976 aa  150  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  25.87 
 
 		 747 aa  149  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  24.1 
 
 		 716 aa  149  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  23.85 
 
 		 749 aa  147  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  29.71 
 
 		 771 aa  147  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.64 
 
 		 784 aa  145  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  27.02 
 
 		 1075 aa  145  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  24.26 
 
 		 706 aa  144  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  24.84 
 
 		 771 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  23.48 
 
 		 761 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  27.51 
 
 		 785 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  23.98 
 
 		 773 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.09 
 
 		 771 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  25.45 
 
 		 846 aa  139  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  26.38 
 
 		 762 aa  137  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  23.74 
 
 		 778 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  23.74 
 
 		 753 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  27.54 
 
 		 811 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  30.73 
 
 		 1084 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  28.07 
 
 		 740 aa  132  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.53 
 
 		 912 aa  131  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.13 
 
 		 769 aa  131  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  25 
 
 		 775 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  31.29 
 
 		 790 aa  128  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  24.56 
 
 		 751 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  27.32 
 
 		 769 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.87 
 
 		 753 aa  126  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  24.31 
 
 		 728 aa  127  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  28.41 
 
 		 821 aa  125  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  32.08 
 
 		 790 aa  125  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  23.18 
 
 		 745 aa  122  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  28.44 
 
 		 777 aa  121  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  25.33 
 
 		 768 aa  120  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  26.9 
 
 		 877 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  26.09 
 
 		 1089 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  25.09 
 
 		 760 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  24.16 
 
 		 986 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.01 
 
 		 955 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.01 
 
 		 986 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.01 
 
 		 986 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.01 
 
 		 986 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.01 
 
 		 955 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  23.88 
 
 		 986 aa  115  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  25.09 
 
 		 961 aa  112  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  26.06 
 
 		 826 aa  111  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  23.02 
 
 		 826 aa  110  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  24.53 
 
 		 771 aa  110  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  25 
 
 		 964 aa  110  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.48 
 
 		 886 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  26.48 
 
 		 886 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  26.48 
 
 		 886 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  25.2 
 
 		 1189 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  26.09 
 
 		 888 aa  104  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  22.76 
 
 		 890 aa  104  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  20 
 
 		 757 aa  98.2  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  21.98 
 
 		 808 aa  96.3  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  24.65 
 
 		 757 aa  95.5  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  23.83 
 
 		 917 aa  94  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  23.83 
 
 		 901 aa  94.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  23.74 
 
 		 819 aa  93.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  23.74 
 
 		 819 aa  93.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  23.74 
 
 		 819 aa  93.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  21.73 
 
 		 806 aa  93.2  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  24.07 
 
 		 899 aa  92.8  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  23.43 
 
 		 900 aa  90.9  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  23.43 
 
 		 900 aa  90.9  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  27.06 
 
 		 754 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7541  Alpha-1,2-mannosidase, putative  23.32 
 
 		 900 aa  90.1  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.439325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3350  glycosyl hydrolase 92  25.63 
 
 		 744 aa  89.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.834613  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  21.53 
 
 		 795 aa  89  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>