222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5941 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 
890 aa  1798    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  42.91 
 
 
1189 aa  531  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  39.21 
 
 
1084 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  46.36 
 
 
1465 aa  486  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  41.11 
 
 
961 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  39.15 
 
 
877 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  39.04 
 
 
986 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  38.87 
 
 
986 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  38.9 
 
 
955 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  38.47 
 
 
955 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  39.24 
 
 
964 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  38.9 
 
 
986 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  38.9 
 
 
986 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  38.9 
 
 
986 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  38.55 
 
 
819 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  38.55 
 
 
819 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  38.55 
 
 
819 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  35.2 
 
 
1089 aa  418  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  37.72 
 
 
823 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.54 
 
 
827 aa  415  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  36.75 
 
 
899 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.43 
 
 
846 aa  389  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  32.98 
 
 
839 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.79 
 
 
849 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  34.36 
 
 
811 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 
1075 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.76 
 
 
784 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.36 
 
 
807 aa  339  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  29.84 
 
 
785 aa  334  5e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  30.94 
 
 
821 aa  333  7.000000000000001e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  32.37 
 
 
784 aa  328  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  32.1 
 
 
790 aa  327  6e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  31.84 
 
 
790 aa  317  8e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.89 
 
 
771 aa  314  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  29.84 
 
 
775 aa  310  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  28.71 
 
 
976 aa  309  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  30.01 
 
 
747 aa  308  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  28.98 
 
 
749 aa  306  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  29.06 
 
 
753 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  31.19 
 
 
777 aa  306  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  29.18 
 
 
773 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  29.77 
 
 
745 aa  302  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  29.2 
 
 
757 aa  299  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  28.82 
 
 
762 aa  297  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  31.01 
 
 
760 aa  296  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  29.57 
 
 
706 aa  290  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.3 
 
 
769 aa  287  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  28.82 
 
 
774 aa  287  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  29.56 
 
 
751 aa  286  9e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  29.01 
 
 
742 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  28.39 
 
 
761 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  27.3 
 
 
759 aa  280  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  27.78 
 
 
778 aa  278  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  27.97 
 
 
747 aa  277  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  28.23 
 
 
769 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  29.68 
 
 
740 aa  271  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  26.99 
 
 
780 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.5 
 
 
900 aa  266  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  30.5 
 
 
900 aa  266  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  27.71 
 
 
782 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  27.01 
 
 
759 aa  261  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.16 
 
 
741 aa  260  9e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  27.13 
 
 
754 aa  259  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  28.9 
 
 
754 aa  257  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  26.09 
 
 
818 aa  254  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  26.35 
 
 
772 aa  254  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  27.01 
 
 
826 aa  253  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  27.35 
 
 
758 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  27.32 
 
 
771 aa  253  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  27.01 
 
 
826 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  27.66 
 
 
795 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  26.09 
 
 
818 aa  248  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  28.39 
 
 
888 aa  243  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7541  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.66 
 
 
900 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.439325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.14 
 
 
886 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  28.14 
 
 
886 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  28.14 
 
 
886 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.33 
 
 
771 aa  236  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  27.09 
 
 
1427 aa  234  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.04 
 
 
781 aa  233  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  25.49 
 
 
760 aa  231  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  27.7 
 
 
1426 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  26.25 
 
 
755 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.39 
 
 
1322 aa  226  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  25.13 
 
 
757 aa  226  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  25.96 
 
 
943 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  26.81 
 
 
764 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  26.75 
 
 
797 aa  220  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  25.9 
 
 
1114 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  26.78 
 
 
806 aa  218  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  26.93 
 
 
1422 aa  218  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  26.17 
 
 
808 aa  217  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  25.18 
 
 
716 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  29.14 
 
 
751 aa  213  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  25.8 
 
 
1124 aa  210  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  25.84 
 
 
753 aa  207  6e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  25.91 
 
 
798 aa  206  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  26.85 
 
 
728 aa  204  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  66.67 
 
 
492 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  25.57 
 
 
901 aa  200  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>