More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3533 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  100 
 
 
488 aa  914    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  65.73 
 
 
384 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.86 
 
 
406 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  48 
 
 
362 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.67 
 
 
362 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.67 
 
 
362 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.78 
 
 
348 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.38 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  40.75 
 
 
348 aa  221  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.82 
 
 
347 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.62 
 
 
517 aa  180  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.85 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.85 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.85 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  35.53 
 
 
377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.28 
 
 
689 aa  147  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.3 
 
 
366 aa  146  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  34.68 
 
 
580 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  34.24 
 
 
819 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  33.55 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  36.36 
 
 
353 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  36.84 
 
 
354 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  34.94 
 
 
1094 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.49 
 
 
354 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.49 
 
 
354 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  35.18 
 
 
556 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  30.52 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  31.12 
 
 
335 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.97 
 
 
752 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  30.12 
 
 
332 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  35.96 
 
 
971 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.81 
 
 
451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
776 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  30.67 
 
 
810 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  29.39 
 
 
1667 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  32.28 
 
 
479 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.33 
 
 
331 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.99 
 
 
366 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.9 
 
 
320 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  32.21 
 
 
1189 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.89 
 
 
328 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  26.25 
 
 
312 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.48 
 
 
362 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.67 
 
 
1170 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  30.64 
 
 
314 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.83 
 
 
362 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  37.44 
 
 
272 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.19 
 
 
345 aa  100  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.43 
 
 
457 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.18 
 
 
335 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.37 
 
 
317 aa  98.6  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.01 
 
 
327 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.18 
 
 
324 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.42 
 
 
415 aa  98.2  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.37 
 
 
324 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.56 
 
 
328 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.92 
 
 
328 aa  97.8  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.7 
 
 
320 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.75 
 
 
336 aa  96.7  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.72 
 
 
330 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.79 
 
 
314 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.88 
 
 
328 aa  94.4  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  31.49 
 
 
487 aa  93.2  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.52 
 
 
338 aa  93.2  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  27.81 
 
 
335 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.15 
 
 
383 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.61 
 
 
334 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.29 
 
 
318 aa  91.3  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.97 
 
 
329 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.65 
 
 
312 aa  90.9  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.66 
 
 
328 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.74 
 
 
328 aa  90.1  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.64 
 
 
328 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.22 
 
 
323 aa  90.1  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  25.25 
 
 
334 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.79 
 
 
314 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.68 
 
 
320 aa  89.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.65 
 
 
329 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.7 
 
 
327 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.36 
 
 
328 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30 
 
 
943 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.58 
 
 
334 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.33 
 
 
329 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.83 
 
 
299 aa  87.8  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.09 
 
 
370 aa  87.4  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.18 
 
 
316 aa  87  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2620  hypothetical protein  25.66 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0272263  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.03 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.4 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.17 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.2 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  27.6 
 
 
408 aa  84  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.73 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  25.33 
 
 
329 aa  83.2  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  24.78 
 
 
339 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6812  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.51 
 
 
363 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.444472  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.61 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  24.18 
 
 
325 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.84 
 
 
310 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.48 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>