More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1838 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  97.81 
 
 
366 aa  708    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
366 aa  722    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  87.66 
 
 
336 aa  534  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  64.29 
 
 
318 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  59.4 
 
 
311 aa  326  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  51.77 
 
 
314 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  58.36 
 
 
311 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.34 
 
 
328 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  43.1 
 
 
325 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.38 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.19 
 
 
313 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  41.53 
 
 
250 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.12 
 
 
310 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  37.92 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.75 
 
 
1667 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  33.33 
 
 
819 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.02 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.35 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.4 
 
 
415 aa  139  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.09 
 
 
316 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.73 
 
 
318 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  32.86 
 
 
810 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  36.12 
 
 
580 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  30.16 
 
 
335 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.36 
 
 
314 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  31.16 
 
 
1094 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  33.09 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.21 
 
 
689 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.1 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.01 
 
 
752 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.75 
 
 
354 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  34.62 
 
 
556 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.69 
 
 
353 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.93 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  30.32 
 
 
332 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  30.4 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.18 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  32.18 
 
 
479 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.14 
 
 
348 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.39 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.75 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.47 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 
776 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  30.9 
 
 
971 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.22 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.21 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0482  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.23 
 
 
326 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.87 
 
 
348 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.97 
 
 
451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.48 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.39 
 
 
348 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.73 
 
 
1170 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  29.45 
 
 
387 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.2 
 
 
317 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.67 
 
 
362 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.53 
 
 
406 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.81 
 
 
328 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.48 
 
 
517 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.77 
 
 
377 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.81 
 
 
324 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.5 
 
 
324 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.32 
 
 
362 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.32 
 
 
362 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.77 
 
 
340 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.77 
 
 
340 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.77 
 
 
340 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.21 
 
 
272 aa  99.4  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.81 
 
 
362 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.74 
 
 
312 aa  99.4  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.47 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.24 
 
 
607 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.03 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.08 
 
 
327 aa  96.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.74 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  31.06 
 
 
1189 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.77 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.83 
 
 
329 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.4 
 
 
328 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.27 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.44 
 
 
338 aa  93.2  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.62 
 
 
330 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.58 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.22 
 
 
345 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.69 
 
 
318 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1165  hypothetical protein  29.34 
 
 
325 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.03 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.81 
 
 
334 aa  91.3  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.4 
 
 
329 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.17 
 
 
334 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.96 
 
 
357 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.3 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.96 
 
 
357 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.57 
 
 
320 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.62 
 
 
327 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.59 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.87 
 
 
328 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.79 
 
 
332 aa  86.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  23.38 
 
 
331 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  29.41 
 
 
306 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>