More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8029 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  100 
 
 
314 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  51.55 
 
 
314 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  49.83 
 
 
314 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  55.29 
 
 
316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  49.16 
 
 
318 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.46 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0482  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  43.86 
 
 
326 aa  182  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.84 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  36.21 
 
 
314 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.24 
 
 
328 aa  165  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.58 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.41 
 
 
318 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  36.58 
 
 
819 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.99 
 
 
311 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.37 
 
 
311 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.06 
 
 
366 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  35.76 
 
 
354 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.74 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.59 
 
 
752 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  38.18 
 
 
330 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.2 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  35.69 
 
 
354 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  32.23 
 
 
1667 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  32.55 
 
 
335 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  36.48 
 
 
353 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.01 
 
 
310 aa  135  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  31.08 
 
 
1094 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.65 
 
 
415 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  35.48 
 
 
479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  34.69 
 
 
580 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
354 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.09 
 
 
689 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  32.99 
 
 
556 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.4 
 
 
457 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  34.6 
 
 
250 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.8 
 
 
366 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  33.6 
 
 
810 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  33.47 
 
 
391 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.14 
 
 
366 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.7 
 
 
312 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  31.27 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  31.44 
 
 
971 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  37.16 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.9 
 
 
365 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.58 
 
 
1170 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 
776 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.38 
 
 
607 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.68 
 
 
451 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27 
 
 
317 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.72 
 
 
335 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  29.33 
 
 
332 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  33.33 
 
 
1189 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.02 
 
 
328 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.9 
 
 
347 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.74 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.27 
 
 
332 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  33.02 
 
 
408 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.24 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  29.27 
 
 
487 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.76 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.76 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.48 
 
 
330 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.76 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 
329 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.17 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.41 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.46 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.86 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.04 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.68 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.06 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.59 
 
 
321 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.92 
 
 
362 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.86 
 
 
348 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.8 
 
 
370 aa  93.6  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.38 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.92 
 
 
334 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.48 
 
 
328 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.88 
 
 
328 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.48 
 
 
328 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.82 
 
 
329 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.07 
 
 
348 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.89 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.38 
 
 
383 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.45 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.35 
 
 
318 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.65 
 
 
362 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.65 
 
 
362 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.65 
 
 
362 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.24 
 
 
517 aa  89  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.88 
 
 
417 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1302  hypothetical protein  30.46 
 
 
364 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.127226  normal  0.259109 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.25 
 
 
334 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3472  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.45 
 
 
394 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.18 
 
 
331 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  34.11 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.11 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.03 
 
 
601 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  38.67 
 
 
154 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>