185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0541 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  61.45 
 
 		 246 aa  120  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  56.48 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  65.82 
 
 		 263 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  59.49 
 
 		 279 aa  106  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  55.17 
 
 		 250 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  51.58 
 
 		 117 aa  97.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  55.95 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  51.81 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  52.69 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.22 
 
 		 517 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  42.48 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  45.1 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  41.91 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  48.42 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  47.78 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  46.88 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  46.94 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  41.46 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  48.94 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  38.98 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  48.91 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  37.33 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  45.05 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  45.05 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  43.96 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  36.84 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  45.56 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  43.27 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  47.3 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  44.79 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  55.74 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  46.99 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  45.88 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  46.34 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  45.57 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  51.39 
 
 		 202 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  43.33 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  38.26 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  48.61 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  48.78 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  48.61 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  39.64 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  42.39 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  47.78 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  37.39 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  52.44 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  45.98 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  45.98 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  34.09 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  39.39 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  36.72 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  40.51 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  42.22 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  40.86 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  40.86 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  50.82 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  50.82 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  50.82 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  50.82 
 
 		 215 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  53.33 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  39.29 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  47.54 
 
 		 265 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  44 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  56.36 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2575  hypothetical protein  30.33 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0843755  normal  0.521427 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  36.17 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  41.84 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  50.82 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  33.66 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  45.9 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  45.9 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1027  protein of unknown function DUF305  29.17 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  55.17 
 
 		 230 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  48.33 
 
 		 205 aa  60.1  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  39.71 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  37.93 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  37.93 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  47.54 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  45.9 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  50 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  43.08 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  41.38 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  45.9 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  47.17 
 
 		 219 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  42.11 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  43.55 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  48.28 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  42.86 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  44.87 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  46.3 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  46.55 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  36.96 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  36.96 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  36.96 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>