178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1291 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1291  putative surface layer protein, with cytochrome c domain  100 
 
 
620 aa  1274    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.304881  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.9 
 
 
974 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.15 
 
 
821 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.85 
 
 
652 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1705  hypothetical protein  25.47 
 
 
634 aa  107  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  22.87 
 
 
827 aa  81.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.27 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  29.81 
 
 
810 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25.48 
 
 
1667 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  29.51 
 
 
329 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  22.34 
 
 
580 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.03 
 
 
332 aa  61.6  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  26.05 
 
 
1577 aa  61.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  31.97 
 
 
330 aa  60.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  24.01 
 
 
387 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.62 
 
 
415 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.21 
 
 
689 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  25.17 
 
 
357 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  25.3 
 
 
304 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  26.1 
 
 
329 aa  57.4  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  26.35 
 
 
250 aa  57.4  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  23.64 
 
 
335 aa  57.4  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  22.78 
 
 
333 aa  57.4  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  24.32 
 
 
333 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  28.46 
 
 
330 aa  57.4  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.29 
 
 
338 aa  57  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  25.48 
 
 
1094 aa  57.4  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  31.76 
 
 
408 aa  57  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  24.74 
 
 
352 aa  57  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.07 
 
 
417 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  24.66 
 
 
333 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  22.11 
 
 
479 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  26.39 
 
 
971 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  26.98 
 
 
357 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  25.62 
 
 
304 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  24.32 
 
 
333 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  24.32 
 
 
333 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  23.25 
 
 
344 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  23.73 
 
 
344 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.24 
 
 
362 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  23.25 
 
 
344 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  23.25 
 
 
344 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.62 
 
 
366 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.62 
 
 
334 aa  55.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  30.95 
 
 
343 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  27 
 
 
556 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.23 
 
 
312 aa  55.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  30.89 
 
 
353 aa  55.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  30.08 
 
 
339 aa  55.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.61 
 
 
1056 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.18 
 
 
366 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  24.3 
 
 
594 aa  54.3  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  26.83 
 
 
314 aa  54.3  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.52 
 
 
327 aa  53.9  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  23.1 
 
 
464 aa  53.9  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.75 
 
 
354 aa  53.9  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1483  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  23.51 
 
 
299 aa  53.9  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0307027  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  29.51 
 
 
324 aa  53.9  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.8 
 
 
362 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  24.23 
 
 
358 aa  53.9  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.58 
 
 
354 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  23.47 
 
 
768 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  32.11 
 
 
425 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  26.94 
 
 
333 aa  52.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.08 
 
 
329 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.32 
 
 
344 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1108  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase; CCP)  28.85 
 
 
287 aa  52.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0173409  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  28.46 
 
 
330 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.25 
 
 
324 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  23.02 
 
 
819 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  29.75 
 
 
351 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.21 
 
 
353 aa  51.2  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  30.91 
 
 
371 aa  51.2  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.68 
 
 
317 aa  51.2  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
776 aa  51.2  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.14 
 
 
328 aa  51.6  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.22 
 
 
1067 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  29.37 
 
 
330 aa  51.2  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2720  hypothetical protein  25.99 
 
 
966 aa  50.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.44 
 
 
314 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  29.21 
 
 
1454 aa  51.2  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.81 
 
 
326 aa  50.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  25.85 
 
 
391 aa  50.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  31.68 
 
 
333 aa  50.8  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  33.68 
 
 
331 aa  50.8  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  31.96 
 
 
417 aa  50.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.81 
 
 
320 aa  50.4  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  23.33 
 
 
342 aa  50.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000355  cytochrome c551 peroxidase  30.33 
 
 
325 aa  50.4  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1734  cytochrome c551 peroxidase  29.87 
 
 
271 aa  50.4  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.841983  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  30 
 
 
333 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3903  Cytochrome-c peroxidase  25.76 
 
 
309 aa  50.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.69 
 
 
335 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  23.94 
 
 
353 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  30.53 
 
 
333 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  31.46 
 
 
306 aa  49.7  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  32.22 
 
 
352 aa  49.7  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4179  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21546  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  29.01 
 
 
365 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4245  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203557  normal  0.147788 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>