202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6985 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 329 aa  671    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  29.93 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  30.33 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2106  cytochrome-c peroxidase  29.33 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  31.11 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1705  hypothetical protein  31.8 
 
 		 634 aa  87  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4384  cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  30.03 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  26.67 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  29.02 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  27.48 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  27.65 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  29.93 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  28.28 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  27.16 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  25.84 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3903  Cytochrome-c peroxidase  28.62 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  30.13 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  27.6 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.34 
 
 		 821 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00242  cytochrome C peroxidase  27.88 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  26.4 
 
 		 431 aa  75.9  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  26.1 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1734  cytochrome c551 peroxidase  24.8 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.841983  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  27.52 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  25.56 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1291  putative surface layer protein, with cytochrome c domain  29.51 
 
 		 620 aa  73.6  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.304881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  26.58 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  27.68 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  27.68 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  25.59 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  27.59 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  27.68 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  25.59 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  25.59 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  26.06 
 
 		 626 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  27.68 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  27.68 
 
 		 465 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  27.68 
 
 		 465 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  27.5 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  27.68 
 
 		 465 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  27.74 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  25.86 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000355  cytochrome c551 peroxidase  27.76 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  27.68 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  26.06 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  28.15 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  28.67 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  25.58 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  27.33 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  30.72 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  26.54 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  27.86 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  28.34 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  27.82 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  27.21 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  28.34 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  27.38 
 
 		 594 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  26.07 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.14 
 
 		 652 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  30.29 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.82 
 
 		 974 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  27.48 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  27.2 
 
 		 571 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  27.33 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  26.1 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  25.17 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  27.33 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  27.33 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  27.33 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  26.49 
 
 		 592 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  27.5 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  26.35 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  25.17 
 
 		 417 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  27.06 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  27.76 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  25.44 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  28.62 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  26.55 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1585  cytochrome-c peroxidase  26.11 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  27.03 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  26.92 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  25.38 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  26.35 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  26.76 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  23.43 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  25.07 
 
 		 626 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  27.96 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  25.48 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  27.51 
 
 		 768 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  26.64 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  26.06 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  26.3 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  27.37 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  29.14 
 
 		 827 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  28.33 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  26.69 
 
 		 464 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>