147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3266 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  76.1 
 
 		 467 aa  733    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  74.07 
 
 		 469 aa  706    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  70.97 
 
 		 465 aa  681    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  74.89 
 
 		 467 aa  721    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  70.66 
 
 		 470 aa  690    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  73.93 
 
 		 451 aa  654    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  74.68 
 
 		 464 aa  725    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  100 
 
 		 466 aa  960    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  57.11 
 
 		 467 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  58.26 
 
 		 466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  55.79 
 
 		 513 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  55.43 
 
 		 509 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  54.4 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  54.12 
 
 		 515 aa  455  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  53.08 
 
 		 522 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  36.11 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  35.97 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  32.56 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  33.57 
 
 		 390 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  36.5 
 
 		 365 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  30.29 
 
 		 352 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  25.6 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  26.1 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  26.67 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  33.1 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  32.65 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  32.26 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  28.73 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  28.57 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  27.42 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  28.18 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  34.15 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  28.97 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  33.57 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  29.93 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  26.15 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  34.15 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  29.93 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  32.17 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  32.87 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4384  cytochrome-c peroxidase  25.75 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.28 
 
 		 821 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  27.91 
 
 		 594 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  33.58 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  31.69 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  28.8 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  25.97 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  32.87 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  29.2 
 
 		 342 aa  56.6  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  29.2 
 
 		 344 aa  55.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 		 358 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  28.67 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  30.57 
 
 		 351 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  31.51 
 
 		 330 aa  54.7  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  28.39 
 
 		 367 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  26.46 
 
 		 399 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1755  Cytochrome-c peroxidase  28.67 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138624  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  32.68 
 
 		 333 aa  53.9  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  31.47 
 
 		 355 aa  53.5  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  28.57 
 
 		 343 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  29.71 
 
 		 594 aa  53.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  26.67 
 
 		 440 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  31.53 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  30.87 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  25.65 
 
 		 1577 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  26.99 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  30.77 
 
 		 352 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  28.86 
 
 		 302 aa  51.2  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  28.35 
 
 		 333 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  28.35 
 
 		 333 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  30.32 
 
 		 353 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  27.22 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  32.43 
 
 		 333 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  28.36 
 
 		 346 aa  50.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  30.07 
 
 		 330 aa  50.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  26.58 
 
 		 348 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  39.74 
 
 		 794 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1734  cytochrome c551 peroxidase  24.29 
 
 		 271 aa  50.4  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.841983  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  33.04 
 
 		 435 aa  50.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00242  cytochrome C peroxidase  28.08 
 
 		 330 aa  50.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  25.62 
 
 		 431 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  26.27 
 
 		 358 aa  50.1  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  26.85 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  32.45 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  29.03 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  28 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  25.97 
 
 		 616 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 347 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  29.57 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2247  putative methylamine utilization protein MauG precursor  30.85 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1705  hypothetical protein  31.86 
 
 		 634 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  31.3 
 
 		 359 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  24.36 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  28.67 
 
 		 352 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  26.45 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  25.91 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  24.36 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  29.2 
 
 		 338 aa  48.5  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  24.66 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>