72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3342 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  100 
 
 		 427 aa  853    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  97.89 
 
 		 427 aa  838    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  92.97 
 
 		 427 aa  801    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  67.33 
 
 		 458 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  65.28 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  64.23 
 
 		 447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0518  hypothetical protein  55.06 
 
 		 490 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  47 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  46.95 
 
 		 390 aa  329  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2098  hypothetical protein  33.89 
 
 		 567 aa  81.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  38.14 
 
 		 515 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  33.58 
 
 		 522 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  34.75 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  35.2 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  36 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  28.89 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  34.15 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5501  hypothetical protein  34.01 
 
 		 653 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  31.45 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  36.79 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  34.38 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  32 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  31.53 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  31.09 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  28.26 
 
 		 328 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  32.33 
 
 		 451 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4871  hypothetical protein  30.41 
 
 		 653 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  27.62 
 
 		 613 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  29.07 
 
 		 360 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5356  hypothetical protein  30.41 
 
 		 653 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  32.85 
 
 		 359 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  31.01 
 
 		 365 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  33.06 
 
 		 353 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  28.47 
 
 		 513 aa  53.5  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  33.59 
 
 		 352 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  28.47 
 
 		 513 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5078  hypothetical protein  28.47 
 
 		 422 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  27.74 
 
 		 592 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  30.87 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2216  hypothetical protein  44.83 
 
 		 547 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  36.84 
 
 		 333 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  32.58 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  32.82 
 
 		 352 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  26.82 
 
 		 450 aa  50.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2940  hypothetical protein  43.1 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  30.43 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  30.3 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2357  hypothetical protein  28.66 
 
 		 645 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  30.83 
 
 		 336 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  22.41 
 
 		 365 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  30.54 
 
 		 794 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  26.96 
 
 		 368 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  29.58 
 
 		 607 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  34.96 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  30.43 
 
 		 594 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  29.27 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  30.9 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  25.46 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3026  hypothetical protein  39.66 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.443921  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  30.99 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.92 
 
 		 821 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  29.03 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  27.21 
 
 		 598 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.21 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  29.35 
 
 		 352 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  27.48 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  25.26 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  34.96 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 346 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  31.37 
 
 		 594 aa  43.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  24.24 
 
 		 768 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>