16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5356 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4871  hypothetical protein  97.24 
 
 		 653 aa  1281    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5501  hypothetical protein  68.84 
 
 		 653 aa  913    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5356  hypothetical protein  100 
 
 		 653 aa  1315    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2357  hypothetical protein  46.86 
 
 		 645 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0153  hypothetical protein  33.28 
 
 		 707 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00172634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0155  hypothetical protein  32.93 
 
 		 708 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  32.21 
 
 		 427 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  30.41 
 
 		 427 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0518  hypothetical protein  25.3 
 
 		 490 aa  54.3  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  25 
 
 		 458 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  29.73 
 
 		 427 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  33.05 
 
 		 425 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 465 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  45.61 
 
 		 447 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  25.32 
 
 		 390 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  32.33 
 
 		 479 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>