75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3151 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  93.44 
 
 
427 aa  805    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  100 
 
 
427 aa  854    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  92.97 
 
 
427 aa  801    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  68.25 
 
 
458 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  66.17 
 
 
465 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  63.73 
 
 
447 aa  513  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0518  hypothetical protein  54.99 
 
 
490 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  46.95 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  47.74 
 
 
425 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2098  hypothetical protein  32.97 
 
 
567 aa  79  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  35.97 
 
 
466 aa  70.5  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  35.77 
 
 
515 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  35.14 
 
 
451 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  32.14 
 
 
470 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  35 
 
 
464 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  35 
 
 
467 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  33.9 
 
 
509 aa  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  35.56 
 
 
465 aa  63.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  31.85 
 
 
469 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  36.54 
 
 
522 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5501  hypothetical protein  33.33 
 
 
653 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951329  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  29.39 
 
 
358 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  27.65 
 
 
613 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  32.43 
 
 
467 aa  60.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  24.13 
 
 
466 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  27.24 
 
 
360 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  31.25 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4871  hypothetical protein  32.21 
 
 
653 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  29.93 
 
 
513 aa  57  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  35.66 
 
 
333 aa  56.6  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  29.93 
 
 
513 aa  56.6  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5356  hypothetical protein  32.21 
 
 
653 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324591  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  29.28 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2216  hypothetical protein  46.55 
 
 
547 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  24.17 
 
 
359 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  33.07 
 
 
365 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  28.14 
 
 
333 aa  53.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  28.65 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  28.7 
 
 
368 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2357  hypothetical protein  25.51 
 
 
645 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  25.24 
 
 
594 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  27.65 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  29.33 
 
 
337 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  30.08 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  26.15 
 
 
594 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5078  hypothetical protein  27.74 
 
 
422 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  24.34 
 
 
365 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  25.99 
 
 
328 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  30.28 
 
 
607 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  26.01 
 
 
311 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  29.71 
 
 
431 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  34.96 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  31.74 
 
 
794 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  25.93 
 
 
592 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  26.01 
 
 
365 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  32.06 
 
 
352 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  26.92 
 
 
341 aa  47.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  32.06 
 
 
352 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  29.03 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  27.86 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 
357 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2940  hypothetical protein  41.38 
 
 
474 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  31.06 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  25.6 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3026  hypothetical protein  41.38 
 
 
473 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.443921  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  30.34 
 
 
302 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.21 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  25.62 
 
 
598 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  32.26 
 
 
346 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  25.21 
 
 
571 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  29.17 
 
 
336 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  32.61 
 
 
328 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  32.99 
 
 
431 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1705  hypothetical protein  29.25 
 
 
634 aa  43.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  25.26 
 
 
417 aa  43.1  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>