51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1954 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  100 
 
 		 465 aa  952    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  61.4 
 
 		 458 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  66.17 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  65.28 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  65.28 
 
 		 427 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  61.26 
 
 		 447 aa  526  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0518  hypothetical protein  57.38 
 
 		 490 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  47.5 
 
 		 390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 425 aa  329  6e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2098  hypothetical protein  26.64 
 
 		 567 aa  94  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  33.1 
 
 		 466 aa  67  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  31.62 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5501  hypothetical protein  29.05 
 
 		 653 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  31.76 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  27.5 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  32.64 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  29.37 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  28.31 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  30.41 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  32.54 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  28.1 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  30.87 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4871  hypothetical protein  31.03 
 
 		 653 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  32.03 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  26.55 
 
 		 337 aa  57  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  31.03 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  28.97 
 
 		 509 aa  56.2  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  25.25 
 
 		 613 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5356  hypothetical protein  29.89 
 
 		 653 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  24.12 
 
 		 333 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  23.98 
 
 		 369 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  25.93 
 
 		 328 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  26.1 
 
 		 353 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  27.22 
 
 		 336 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  25.97 
 
 		 513 aa  50.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  25.97 
 
 		 513 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3026  hypothetical protein  37.35 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.443921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 521 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 592 aa  46.6  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  26.42 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  25.42 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  26.18 
 
 		 302 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  25.84 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2357  hypothetical protein  34.72 
 
 		 645 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  31.53 
 
 		 594 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  27.87 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  27.05 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2940  hypothetical protein  33.73 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  25.18 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  25.93 
 
 		 330 aa  44.3  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  23.81 
 
 		 359 aa  43.9  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>