77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0488 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  100 
 
 		 467 aa  974    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  68 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  56.65 
 
 		 467 aa  558  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  58.3 
 
 		 469 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  58.11 
 
 		 465 aa  551  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  56.64 
 
 		 467 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  55.96 
 
 		 470 aa  554  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  57.7 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  57.11 
 
 		 466 aa  547  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  60.71 
 
 		 515 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  59.53 
 
 		 509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  59.91 
 
 		 513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  54.42 
 
 		 451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  60.33 
 
 		 522 aa  515  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  60.14 
 
 		 513 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  31.51 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  34.38 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  24.73 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  28.31 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  32.43 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  26.95 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  26.24 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  24.91 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  26.45 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  33.85 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.8 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  24.91 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  28.35 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  29.73 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 616 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  28.83 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  21.55 
 
 		 329 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  29.23 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  28.12 
 
 		 333 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  26.99 
 
 		 594 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  31.82 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  28.08 
 
 		 626 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  28.46 
 
 		 343 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  23.78 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  26.88 
 
 		 594 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  28.18 
 
 		 344 aa  50.4  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  23.68 
 
 		 334 aa  50.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  30 
 
 		 344 aa  50.8  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  27.43 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  27.19 
 
 		 346 aa  50.1  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  26.83 
 
 		 353 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  31.07 
 
 		 417 aa  50.1  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  26.49 
 
 		 613 aa  50.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  28.95 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  28.95 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.32 
 
 		 821 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  27.13 
 
 		 302 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  25.93 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  30.17 
 
 		 353 aa  47.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  28.12 
 
 		 521 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  22.73 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  28.15 
 
 		 768 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  27.69 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  28.45 
 
 		 339 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  26.45 
 
 		 598 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  26.24 
 
 		 607 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  27.45 
 
 		 592 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 397 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  21.19 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  26.35 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  26.85 
 
 		 571 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2940  hypothetical protein  27.34 
 
 		 474 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  28 
 
 		 359 aa  43.5  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  29.91 
 
 		 341 aa  43.9  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  26.21 
 
 		 401 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2216  hypothetical protein  38.78 
 
 		 547 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  24.27 
 
 		 827 aa  43.5  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  27.34 
 
 		 343 aa  43.1  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>