293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0368 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  100 
 
 		 1577 aa  3235    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  41.31 
 
 		 827 aa  491  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  40.73 
 
 		 1295 aa  350  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.71 
 
 		 652 aa  189  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  40.37 
 
 		 1504 aa  132  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.34 
 
 		 821 aa  108  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.77 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  38.33 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  41.32 
 
 		 801 aa  79.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.67 
 
 		 1916 aa  77.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1699 aa  77  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1667 aa  76.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  39.32 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  33.09 
 
 		 748 aa  75.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35 
 
 		 494 aa  74.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  24.29 
 
 		 810 aa  73.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.57 
 
 		 974 aa  71.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  24.01 
 
 		 819 aa  70.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  23.45 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.33 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  34.65 
 
 		 794 aa  68.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 469 aa  68.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  30.17 
 
 		 548 aa  68.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  34.62 
 
 		 806 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6221  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.58 
 
 		 810 aa  67.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  27.04 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  28.97 
 
 		 801 aa  65.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  35.29 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  35.77 
 
 		 535 aa  65.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  35.59 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  34.75 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  28.75 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  35.54 
 
 		 472 aa  64.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  36.97 
 
 		 803 aa  65.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  35.54 
 
 		 490 aa  65.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  41.8 
 
 		 492 aa  64.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  29.57 
 
 		 1565 aa  63.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.29 
 
 		 498 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  35 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  24.09 
 
 		 971 aa  62.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  33.33 
 
 		 1100 aa  62  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  33.08 
 
 		 806 aa  62  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  33.08 
 
 		 806 aa  62  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  33.08 
 
 		 806 aa  62  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.08 
 
 		 806 aa  62  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  31.85 
 
 		 1189 aa  61.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  35 
 
 		 374 aa  61.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1705  hypothetical protein  22.4 
 
 		 634 aa  61.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  37.7 
 
 		 574 aa  61.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  32 
 
 		 737 aa  60.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  33.88 
 
 		 1222 aa  60.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  31.62 
 
 		 186 aa  60.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 		 354 aa  60.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1291  putative surface layer protein, with cytochrome c domain  26.05 
 
 		 620 aa  61.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.304881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  32.31 
 
 		 806 aa  60.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  32.12 
 
 		 806 aa  60.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.31 
 
 		 806 aa  60.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  32.71 
 
 		 497 aa  60.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  25.19 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  23.33 
 
 		 317 aa  59.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  29.13 
 
 		 672 aa  59.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  34.75 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  34.71 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  24.8 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.59 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  32.28 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.59 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  33.62 
 
 		 1150 aa  58.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  30.4 
 
 		 1049 aa  58.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  29.23 
 
 		 691 aa  58.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  29.84 
 
 		 401 aa  58.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1170 aa  58.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.23 
 
 		 514 aa  57.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  30.83 
 
 		 801 aa  57.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  32.8 
 
 		 647 aa  57.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 465 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.95 
 
 		 933 aa  57.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  32.46 
 
 		 651 aa  57.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  39.74 
 
 		 1016 aa  57.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  20.51 
 
 		 354 aa  57.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  29.92 
 
 		 493 aa  57.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  33.91 
 
 		 603 aa  57  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  44.58 
 
 		 451 aa  57  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.93 
 
 		 493 aa  57  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  25.2 
 
 		 464 aa  56.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  26.19 
 
 		 594 aa  57  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  26.14 
 
 		 470 aa  56.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  30.89 
 
 		 1567 aa  56.2  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  26.1 
 
 		 365 aa  56.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  33.33 
 
 		 4357 aa  56.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 390 aa  56.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  28.79 
 
 		 306 aa  56.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  20.89 
 
 		 324 aa  55.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  26.98 
 
 		 352 aa  55.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.77 
 
 		 500 aa  55.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.35 
 
 		 4761 aa  55.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  25.26 
 
 		 431 aa  55.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.48 
 
 		 345 aa  55.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  32.48 
 
 		 663 aa  55.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>