64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2562 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  75.94 
 
 		 479 aa  705    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  975    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  75.49 
 
 		 492 aa  671    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  68.94 
 
 		 503 aa  625  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  50.64 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  51.32 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  50.53 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  49.12 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  49.23 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  49.45 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  49.67 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  48.79 
 
 		 475 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  50.22 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  48.57 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  49.23 
 
 		 475 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  49.67 
 
 		 475 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  48.34 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  48.34 
 
 		 443 aa  425  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  51.13 
 
 		 471 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  49.33 
 
 		 461 aa  418  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  48.34 
 
 		 480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  45.75 
 
 		 510 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  44.83 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  45.13 
 
 		 502 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  45.08 
 
 		 517 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  46.15 
 
 		 503 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  45.75 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  44.92 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  46.47 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  44.81 
 
 		 512 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  44.15 
 
 		 512 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  44.55 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  42.45 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  44.06 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  43.6 
 
 		 517 aa  346  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  41.3 
 
 		 528 aa  336  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  39.96 
 
 		 562 aa  333  3e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  39.41 
 
 		 560 aa  333  3e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  39.83 
 
 		 541 aa  332  8e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  38.03 
 
 		 491 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  39.48 
 
 		 541 aa  302  9e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  38.8 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  38.45 
 
 		 548 aa  297  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  38.4 
 
 		 541 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  36.4 
 
 		 542 aa  297  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  38.03 
 
 		 543 aa  296  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  36.61 
 
 		 459 aa  292  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  37.08 
 
 		 539 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  37.2 
 
 		 549 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  36.49 
 
 		 538 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  38.22 
 
 		 418 aa  276  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  42.23 
 
 		 427 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  39.95 
 
 		 879 aa  257  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  39.16 
 
 		 1028 aa  250  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  35.17 
 
 		 1707 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  35.87 
 
 		 970 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  36.85 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  34.34 
 
 		 737 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  31.83 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  30.12 
 
 		 794 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  29.83 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  25.14 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  25.12 
 
 		 564 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13411  hypothetical protein  39.76 
 
 		 106 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>