48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_13411 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_13411  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  219  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  39.76 
 
 
492 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  36.9 
 
 
541 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  36.9 
 
 
541 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  38.64 
 
 
427 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  42.17 
 
 
517 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  36.47 
 
 
548 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  33.33 
 
 
542 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  39.33 
 
 
418 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  38.55 
 
 
512 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  40.23 
 
 
503 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  39.76 
 
 
475 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  36.17 
 
 
503 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  35.71 
 
 
551 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  38.55 
 
 
528 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  36.71 
 
 
469 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  37.04 
 
 
452 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  38.46 
 
 
479 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  37.35 
 
 
512 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  35.8 
 
 
471 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  34.86 
 
 
502 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  30.12 
 
 
543 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  39.02 
 
 
502 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  36.56 
 
 
480 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  37.35 
 
 
475 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  39.76 
 
 
473 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  36.26 
 
 
470 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  34.88 
 
 
538 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  35.87 
 
 
502 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  33.72 
 
 
450 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  36.14 
 
 
475 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  34.07 
 
 
970 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  37.04 
 
 
517 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  33.33 
 
 
539 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  34.52 
 
 
549 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  32.95 
 
 
491 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  31.52 
 
 
501 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  34.12 
 
 
462 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  39.62 
 
 
459 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  33.33 
 
 
473 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  36.71 
 
 
475 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  32.99 
 
 
510 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  36.71 
 
 
475 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  36.14 
 
 
475 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  36.71 
 
 
475 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  34.78 
 
 
461 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  34.04 
 
 
541 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  39.29 
 
 
471 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>