70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0972 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  61.52 
 
 
538 aa  651    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  74.49 
 
 
542 aa  833    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  74.09 
 
 
543 aa  811    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  75.14 
 
 
548 aa  843    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  98.15 
 
 
541 aa  1102    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  74.91 
 
 
539 aa  827    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  76.77 
 
 
551 aa  863    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  100 
 
 
541 aa  1121    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  77.74 
 
 
549 aa  857    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  39.15 
 
 
473 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  38.86 
 
 
491 aa  309  8e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  40.66 
 
 
480 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  39.24 
 
 
473 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  39.64 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  38 
 
 
461 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  37.63 
 
 
443 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  37.73 
 
 
460 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  37.4 
 
 
503 aa  300  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  38.4 
 
 
475 aa  297  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  40.73 
 
 
471 aa  294  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  36.65 
 
 
462 aa  289  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  36.87 
 
 
475 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  38.79 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  36.27 
 
 
475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  36.93 
 
 
475 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  36.38 
 
 
475 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  38.08 
 
 
510 aa  283  7.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  39.16 
 
 
503 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  39.63 
 
 
470 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  36.17 
 
 
475 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  37.87 
 
 
512 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  36.15 
 
 
502 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  36.38 
 
 
502 aa  277  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  37.01 
 
 
452 aa  276  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  36.82 
 
 
418 aa  276  7e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  36.38 
 
 
502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  37.91 
 
 
501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  37.12 
 
 
479 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  36.14 
 
 
541 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  35.28 
 
 
475 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  36.92 
 
 
475 aa  273  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  37.63 
 
 
517 aa  272  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  35.75 
 
 
560 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  38.18 
 
 
512 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  35.34 
 
 
456 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  35.57 
 
 
562 aa  264  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  38.38 
 
 
427 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  35.47 
 
 
517 aa  262  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  34.2 
 
 
528 aa  254  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  36.48 
 
 
471 aa  249  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  35.05 
 
 
450 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  33.6 
 
 
459 aa  236  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  34.26 
 
 
879 aa  220  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  33.96 
 
 
1028 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  42.81 
 
 
970 aa  203  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  39.27 
 
 
1707 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  28.74 
 
 
472 aa  144  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  35.76 
 
 
794 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  29.65 
 
 
421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  47.8 
 
 
737 aa  127  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  28.66 
 
 
511 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  25.76 
 
 
519 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  29.06 
 
 
564 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13411  hypothetical protein  36.9 
 
 
106 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13401  hypothetical protein  60.98 
 
 
41 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  27.22 
 
 
333 aa  48.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.86 
 
 
652 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  34.26 
 
 
365 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  28.18 
 
 
827 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  25.42 
 
 
459 aa  45.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>